Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKX8

ERCC6L, DNA excision repair protein ERCC-6-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6LQ2NKX8 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ERCC6LQ2NKX8 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERCC6LQ2NKX8 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ERCC6LQ2NKX8 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ERCC6LQ2NKX8 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERCC6LQ2NKX8 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERCC6LQ2NKX8 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERCC6LQ2NKX8 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERCC6LQ2NKX8 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ERCC6LQ2NKX8 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERCC6LQ2NKX8 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ERCC6LQ2NKX8 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ERCC6LQ2NKX8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERCC6LQ2NKX8 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ERCC6LQ2NKX8 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERCC6LQ2NKX8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ERCC6LQ2NKX8 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ERCC6LQ2NKX8 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERCC6LQ2NKX8 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERCC6LQ2NKX8 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ERCC6LQ2NKX8 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ERCC6LQ2NKX8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ERCC6LQ2NKX8 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERCC6LQ2NKX8 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERCC6LQ2NKX8 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERCC6LQ2NKX8 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERCC6LQ2NKX8 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERCC6LQ2NKX8 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERCC6LQ2NKX8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERCC6LQ2NKX8 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERCC6LQ2NKX8 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERCC6LQ2NKX8 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERCC6LQ2NKX8 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERCC6LQ2NKX8 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERCC6LQ2NKX8 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERCC6LQ2NKX8 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERCC6LQ2NKX8 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERCC6LQ2NKX8 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERCC6LQ2NKX8 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERCC6LQ2NKX8 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERCC6LQ2NKX8 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERCC6LQ2NKX8 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERCC6LQ2NKX8 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERCC6LQ2NKX8 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERCC6LQ2NKX8 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERCC6LQ2NKX8 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERCC6LQ2NKX8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERCC6LQ2NKX8 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERCC6LQ2NKX8 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERCC6LQ2NKX8 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERCC6LQ2NKX8 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERCC6LQ2NKX8 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERCC6LQ2NKX8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ERCC6LQ2NKX8 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERCC6LQ2NKX8 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERCC6LQ2NKX8 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERCC6LQ2NKX8 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERCC6LQ2NKX8 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERCC6LQ2NKX8 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERCC6LQ2NKX8 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERCC6LQ2NKX8 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERCC6LQ2NKX8 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERCC6LQ2NKX8 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERCC6LQ2NKX8 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERCC6LQ2NKX8 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERCC6LQ2NKX8 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERCC6LQ2NKX8 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERCC6LQ2NKX8 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERCC6LQ2NKX8 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERCC6LQ2NKX8 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERCC6LQ2NKX8 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERCC6LQ2NKX8 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERCC6LQ2NKX8 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERCC6LQ2NKX8 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERCC6LQ2NKX8 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERCC6LQ2NKX8 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ERCC6LQ2NKX8 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERCC6LQ2NKX8 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERCC6LQ2NKX8 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ERCC6LQ2NKX8 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERCC6LQ2NKX8 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERCC6LQ2NKX8 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERCC6LQ2NKX8 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERCC6LQ2NKX8 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERCC6LQ2NKX8 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERCC6LQ2NKX8 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERCC6LQ2NKX8 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERCC6LQ2NKX8 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERCC6LQ2NKX8 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERCC6LQ2NKX8 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERCC6LQ2NKX8 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERCC6LQ2NKX8 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERCC6LQ2NKX8 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERCC6LQ2NKX8 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERCC6LQ2NKX8 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERCC6LQ2NKX8 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERCC6LQ2NKX8 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERCC6LQ2NKX8 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERCC6LQ2NKX8 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERCC6LQ2NKX8 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms