Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CSPP1Q1MSJ5 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CSPP1Q1MSJ5 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CSPP1Q1MSJ5 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CSPP1Q1MSJ5 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CSPP1Q1MSJ5 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CSPP1Q1MSJ5 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSPP1Q1MSJ5 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSPP1Q1MSJ5 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSPP1Q1MSJ5 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSPP1Q1MSJ5 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSPP1Q1MSJ5 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSPP1Q1MSJ5 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSPP1Q1MSJ5 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSPP1Q1MSJ5 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSPP1Q1MSJ5 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSPP1Q1MSJ5 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSPP1Q1MSJ5 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSPP1Q1MSJ5 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSPP1Q1MSJ5 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSPP1Q1MSJ5 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSPP1Q1MSJ5 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSPP1Q1MSJ5 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSPP1Q1MSJ5 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSPP1Q1MSJ5 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSPP1Q1MSJ5 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CSPP1Q1MSJ5 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CSPP1Q1MSJ5 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CSPP1Q1MSJ5 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CSPP1Q1MSJ5 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CSPP1Q1MSJ5 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CSPP1Q1MSJ5 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CSPP1Q1MSJ5 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CSPP1Q1MSJ5 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CSPP1Q1MSJ5 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CSPP1Q1MSJ5 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CSPP1Q1MSJ5 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CSPP1Q1MSJ5 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CSPP1Q1MSJ5 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CSPP1Q1MSJ5 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSPP1Q1MSJ5 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSPP1Q1MSJ5 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSPP1Q1MSJ5 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSPP1Q1MSJ5 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSPP1Q1MSJ5 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSPP1Q1MSJ5 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSPP1Q1MSJ5 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSPP1Q1MSJ5 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSPP1Q1MSJ5 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSPP1Q1MSJ5 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSPP1Q1MSJ5 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSPP1Q1MSJ5 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSPP1Q1MSJ5 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSPP1Q1MSJ5 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSPP1Q1MSJ5 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSPP1Q1MSJ5 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSPP1Q1MSJ5 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSPP1Q1MSJ5 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSPP1Q1MSJ5 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSPP1Q1MSJ5 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
CSPP1Q1MSJ5 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSPP1Q1MSJ5 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSPP1Q1MSJ5 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSPP1Q1MSJ5 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSPP1Q1MSJ5 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSPP1Q1MSJ5 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSPP1Q1MSJ5 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CSPP1Q1MSJ5 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSPP1Q1MSJ5 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSPP1Q1MSJ5 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSPP1Q1MSJ5 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSPP1Q1MSJ5 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSPP1Q1MSJ5 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSPP1Q1MSJ5 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSPP1Q1MSJ5 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSPP1Q1MSJ5 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSPP1Q1MSJ5 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSPP1Q1MSJ5 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSPP1Q1MSJ5 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSPP1Q1MSJ5 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSPP1Q1MSJ5 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSPP1Q1MSJ5 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSPP1Q1MSJ5 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CSPP1Q1MSJ5 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSPP1Q1MSJ5 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSPP1Q1MSJ5 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSPP1Q1MSJ5 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSPP1Q1MSJ5 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSPP1Q1MSJ5 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSPP1Q1MSJ5 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CSPP1Q1MSJ5 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSPP1Q1MSJ5 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSPP1Q1MSJ5 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSPP1Q1MSJ5 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSPP1Q1MSJ5 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSPP1Q1MSJ5 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSPP1Q1MSJ5 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSPP1Q1MSJ5 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSPP1Q1MSJ5 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CSPP1Q1MSJ5 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms