Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KNOP1Q1ED39 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KNOP1Q1ED39 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KNOP1Q1ED39 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KNOP1Q1ED39 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KNOP1Q1ED39 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KNOP1Q1ED39 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KNOP1Q1ED39 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KNOP1Q1ED39 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KNOP1Q1ED39 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KNOP1Q1ED39 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
KNOP1Q1ED39 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KNOP1Q1ED39 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KNOP1Q1ED39 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KNOP1Q1ED39 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KNOP1Q1ED39 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KNOP1Q1ED39 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
KNOP1Q1ED39 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KNOP1Q1ED39 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KNOP1Q1ED39 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
KNOP1Q1ED39 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
KNOP1Q1ED39 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
KNOP1Q1ED39 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KNOP1Q1ED39 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KNOP1Q1ED39 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KNOP1Q1ED39 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KNOP1Q1ED39 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KNOP1Q1ED39 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KNOP1Q1ED39 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
KNOP1Q1ED39 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KNOP1Q1ED39 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KNOP1Q1ED39 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KNOP1Q1ED39 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KNOP1Q1ED39 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KNOP1Q1ED39 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KNOP1Q1ED39 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KNOP1Q1ED39 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KNOP1Q1ED39 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KNOP1Q1ED39 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KNOP1Q1ED39 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KNOP1Q1ED39 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KNOP1Q1ED39 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KNOP1Q1ED39 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KNOP1Q1ED39 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KNOP1Q1ED39 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KNOP1Q1ED39 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
KNOP1Q1ED39 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KNOP1Q1ED39 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KNOP1Q1ED39 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KNOP1Q1ED39 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KNOP1Q1ED39 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KNOP1Q1ED39 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KNOP1Q1ED39 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KNOP1Q1ED39 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KNOP1Q1ED39 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KNOP1Q1ED39 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KNOP1Q1ED39 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
KNOP1Q1ED39 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KNOP1Q1ED39 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KNOP1Q1ED39 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KNOP1Q1ED39 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KNOP1Q1ED39 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KNOP1Q1ED39 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KNOP1Q1ED39 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KNOP1Q1ED39 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KNOP1Q1ED39 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KNOP1Q1ED39 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KNOP1Q1ED39 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KNOP1Q1ED39 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
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