Protein–RNA interactions for Protein: Q17RG1

KCTD19, BTB/POZ domain-containing protein KCTD19, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 926 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD19Q17RG1 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KCTD19Q17RG1 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KCTD19Q17RG1 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KCTD19Q17RG1 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KCTD19Q17RG1 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KCTD19Q17RG1 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KCTD19Q17RG1 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KCTD19Q17RG1 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KCTD19Q17RG1 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KCTD19Q17RG1 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KCTD19Q17RG1 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KCTD19Q17RG1 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KCTD19Q17RG1 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KCTD19Q17RG1 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KCTD19Q17RG1 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KCTD19Q17RG1 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KCTD19Q17RG1 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KCTD19Q17RG1 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KCTD19Q17RG1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KCTD19Q17RG1 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
KCTD19Q17RG1 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KCTD19Q17RG1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KCTD19Q17RG1 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KCTD19Q17RG1 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KCTD19Q17RG1 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KCTD19Q17RG1 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KCTD19Q17RG1 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KCTD19Q17RG1 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KCTD19Q17RG1 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KCTD19Q17RG1 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KCTD19Q17RG1 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KCTD19Q17RG1 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KCTD19Q17RG1 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KCTD19Q17RG1 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KCTD19Q17RG1 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
KCTD19Q17RG1 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KCTD19Q17RG1 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KCTD19Q17RG1 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KCTD19Q17RG1 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KCTD19Q17RG1 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KCTD19Q17RG1 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KCTD19Q17RG1 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KCTD19Q17RG1 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KCTD19Q17RG1 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KCTD19Q17RG1 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KCTD19Q17RG1 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KCTD19Q17RG1 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KCTD19Q17RG1 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KCTD19Q17RG1 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
KCTD19Q17RG1 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KCTD19Q17RG1 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KCTD19Q17RG1 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KCTD19Q17RG1 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KCTD19Q17RG1 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KCTD19Q17RG1 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KCTD19Q17RG1 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KCTD19Q17RG1 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KCTD19Q17RG1 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KCTD19Q17RG1 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KCTD19Q17RG1 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KCTD19Q17RG1 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KCTD19Q17RG1 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KCTD19Q17RG1 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KCTD19Q17RG1 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KCTD19Q17RG1 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KCTD19Q17RG1 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KCTD19Q17RG1 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KCTD19Q17RG1 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KCTD19Q17RG1 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KCTD19Q17RG1 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KCTD19Q17RG1 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KCTD19Q17RG1 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KCTD19Q17RG1 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KCTD19Q17RG1 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KCTD19Q17RG1 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KCTD19Q17RG1 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KCTD19Q17RG1 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KCTD19Q17RG1 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KCTD19Q17RG1 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KCTD19Q17RG1 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KCTD19Q17RG1 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KCTD19Q17RG1 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KCTD19Q17RG1 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KCTD19Q17RG1 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KCTD19Q17RG1 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KCTD19Q17RG1 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KCTD19Q17RG1 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
KCTD19Q17RG1 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KCTD19Q17RG1 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KCTD19Q17RG1 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KCTD19Q17RG1 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KCTD19Q17RG1 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KCTD19Q17RG1 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KCTD19Q17RG1 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KCTD19Q17RG1 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KCTD19Q17RG1 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KCTD19Q17RG1 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KCTD19Q17RG1 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KCTD19Q17RG1 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KCTD19Q17RG1 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms