Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
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RTL8BQ17RB0 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
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