Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRNQ16849 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRNQ16849 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRNQ16849 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRNQ16849 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRNQ16849 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRNQ16849 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRNQ16849 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPRNQ16849 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPRNQ16849 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPRNQ16849 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPRNQ16849 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPRNQ16849 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPRNQ16849 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPRNQ16849 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPRNQ16849 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRNQ16849 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRNQ16849 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRNQ16849 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRNQ16849 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRNQ16849 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRNQ16849 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRNQ16849 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRNQ16849 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRNQ16849 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRNQ16849 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRNQ16849 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRNQ16849 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRNQ16849 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRNQ16849 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRNQ16849 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRNQ16849 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRNQ16849 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRNQ16849 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRNQ16849 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRNQ16849 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRNQ16849 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRNQ16849 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRNQ16849 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRNQ16849 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRNQ16849 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRNQ16849 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRNQ16849 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRNQ16849 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRNQ16849 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
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PTPRNQ16849 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRNQ16849 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
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PTPRNQ16849 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRNQ16849 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRNQ16849 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
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PTPRNQ16849 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRNQ16849 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
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PTPRNQ16849 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRNQ16849 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRNQ16849 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRNQ16849 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRNQ16849 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRNQ16849 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRNQ16849 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
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PTPRNQ16849 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
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PTPRNQ16849 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRNQ16849 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
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PTPRNQ16849 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRNQ16849 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRNQ16849 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRNQ16849 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRNQ16849 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRNQ16849 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRNQ16849 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRNQ16849 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRNQ16849 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRNQ16849 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRNQ16849 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRNQ16849 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRNQ16849 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRNQ16849 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRNQ16849 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRNQ16849 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRNQ16849 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRNQ16849 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRNQ16849 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRNQ16849 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
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