Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP2B3Q16720 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP2B3Q16720 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP2B3Q16720 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP2B3Q16720 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP2B3Q16720 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP2B3Q16720 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP2B3Q16720 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP2B3Q16720 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP2B3Q16720 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP2B3Q16720 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP2B3Q16720 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP2B3Q16720 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP2B3Q16720 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP2B3Q16720 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP2B3Q16720 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP2B3Q16720 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP2B3Q16720 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP2B3Q16720 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP2B3Q16720 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP2B3Q16720 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP2B3Q16720 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP2B3Q16720 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP2B3Q16720 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP2B3Q16720 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP2B3Q16720 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP2B3Q16720 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP2B3Q16720 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP2B3Q16720 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP2B3Q16720 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP2B3Q16720 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP2B3Q16720 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP2B3Q16720 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP2B3Q16720 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP2B3Q16720 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP2B3Q16720 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP2B3Q16720 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP2B3Q16720 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP2B3Q16720 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP2B3Q16720 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP2B3Q16720 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP2B3Q16720 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP2B3Q16720 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP2B3Q16720 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP2B3Q16720 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP2B3Q16720 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP2B3Q16720 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP2B3Q16720 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP2B3Q16720 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP2B3Q16720 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP2B3Q16720 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP2B3Q16720 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP2B3Q16720 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP2B3Q16720 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP2B3Q16720 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP2B3Q16720 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP2B3Q16720 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP2B3Q16720 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP2B3Q16720 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP2B3Q16720 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP2B3Q16720 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP2B3Q16720 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP2B3Q16720 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP2B3Q16720 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP2B3Q16720 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP2B3Q16720 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP2B3Q16720 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP2B3Q16720 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP2B3Q16720 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP2B3Q16720 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP2B3Q16720 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP2B3Q16720 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP2B3Q16720 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP2B3Q16720 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP2B3Q16720 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP2B3Q16720 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP2B3Q16720 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP2B3Q16720 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP2B3Q16720 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP2B3Q16720 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP2B3Q16720 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP2B3Q16720 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATP2B3Q16720 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATP2B3Q16720 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATP2B3Q16720 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATP2B3Q16720 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATP2B3Q16720 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATP2B3Q16720 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATP2B3Q16720 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATP2B3Q16720 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATP2B3Q16720 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATP2B3Q16720 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATP2B3Q16720 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATP2B3Q16720 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATP2B3Q16720 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATP2B3Q16720 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATP2B3Q16720 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATP2B3Q16720 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATP2B3Q16720 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATP2B3Q16720 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
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