Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDKN3Q16667 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDKN3Q16667 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDKN3Q16667 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDKN3Q16667 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDKN3Q16667 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDKN3Q16667 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDKN3Q16667 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDKN3Q16667 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDKN3Q16667 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDKN3Q16667 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDKN3Q16667 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDKN3Q16667 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDKN3Q16667 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDKN3Q16667 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDKN3Q16667 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDKN3Q16667 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDKN3Q16667 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDKN3Q16667 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDKN3Q16667 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDKN3Q16667 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDKN3Q16667 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDKN3Q16667 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDKN3Q16667 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDKN3Q16667 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CDKN3Q16667 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDKN3Q16667 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDKN3Q16667 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDKN3Q16667 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDKN3Q16667 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDKN3Q16667 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDKN3Q16667 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDKN3Q16667 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDKN3Q16667 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDKN3Q16667 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDKN3Q16667 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDKN3Q16667 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDKN3Q16667 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDKN3Q16667 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDKN3Q16667 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDKN3Q16667 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDKN3Q16667 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDKN3Q16667 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CDKN3Q16667 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDKN3Q16667 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDKN3Q16667 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDKN3Q16667 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDKN3Q16667 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDKN3Q16667 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDKN3Q16667 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDKN3Q16667 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDKN3Q16667 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDKN3Q16667 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDKN3Q16667 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDKN3Q16667 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CDKN3Q16667 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDKN3Q16667 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDKN3Q16667 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDKN3Q16667 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDKN3Q16667 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CDKN3Q16667 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDKN3Q16667 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDKN3Q16667 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDKN3Q16667 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDKN3Q16667 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDKN3Q16667 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDKN3Q16667 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDKN3Q16667 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDKN3Q16667 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDKN3Q16667 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDKN3Q16667 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDKN3Q16667 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDKN3Q16667 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDKN3Q16667 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDKN3Q16667 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDKN3Q16667 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDKN3Q16667 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDKN3Q16667 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDKN3Q16667 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDKN3Q16667 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDKN3Q16667 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDKN3Q16667 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDKN3Q16667 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDKN3Q16667 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDKN3Q16667 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDKN3Q16667 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDKN3Q16667 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CDKN3Q16667 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDKN3Q16667 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDKN3Q16667 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CDKN3Q16667 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDKN3Q16667 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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