Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FXNQ16595 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FXNQ16595 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FXNQ16595 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FXNQ16595 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FXNQ16595 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FXNQ16595 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FXNQ16595 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FXNQ16595 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FXNQ16595 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FXNQ16595 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FXNQ16595 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
FXNQ16595 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FXNQ16595 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FXNQ16595 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FXNQ16595 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FXNQ16595 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FXNQ16595 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FXNQ16595 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FXNQ16595 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FXNQ16595 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FXNQ16595 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FXNQ16595 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FXNQ16595 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FXNQ16595 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FXNQ16595 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FXNQ16595 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FXNQ16595 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FXNQ16595 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FXNQ16595 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FXNQ16595 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FXNQ16595 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FXNQ16595 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FXNQ16595 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FXNQ16595 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FXNQ16595 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FXNQ16595 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FXNQ16595 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FXNQ16595 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FXNQ16595 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FXNQ16595 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FXNQ16595 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FXNQ16595 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FXNQ16595 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FXNQ16595 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FXNQ16595 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FXNQ16595 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
FXNQ16595 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
FXNQ16595 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
FXNQ16595 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
FXNQ16595 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
FXNQ16595 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
FXNQ16595 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
FXNQ16595 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
FXNQ16595 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FXNQ16595 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
FXNQ16595 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FXNQ16595 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FXNQ16595 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FXNQ16595 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FXNQ16595 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
FXNQ16595 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
FXNQ16595 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
FXNQ16595 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
FXNQ16595 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
FXNQ16595 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FXNQ16595 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
FXNQ16595 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FXNQ16595 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FXNQ16595 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FXNQ16595 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FXNQ16595 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FXNQ16595 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FXNQ16595 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FXNQ16595 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FXNQ16595 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FXNQ16595 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FXNQ16595 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FXNQ16595 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FXNQ16595 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FXNQ16595 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
FXNQ16595 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
FXNQ16595 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
FXNQ16595 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FXNQ16595 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FXNQ16595 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FXNQ16595 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
FXNQ16595 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
FXNQ16595 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
FXNQ16595 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
FXNQ16595 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
FXNQ16595 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
FXNQ16595 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FXNQ16595 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FXNQ16595 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FXNQ16595 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FXNQ16595 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FXNQ16595 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FXNQ16595 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FXNQ16595 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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