Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
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SGCAQ16586 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SGCAQ16586 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SGCAQ16586 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SGCAQ16586 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SGCAQ16586 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SGCAQ16586 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SGCAQ16586 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SGCAQ16586 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SGCAQ16586 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SGCAQ16586 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SGCAQ16586 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SGCAQ16586 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SGCAQ16586 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SGCAQ16586 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SGCAQ16586 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SGCAQ16586 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SGCAQ16586 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SGCAQ16586 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SGCAQ16586 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SGCAQ16586 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SGCAQ16586 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SGCAQ16586 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SGCAQ16586 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SGCAQ16586 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SGCAQ16586 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SGCAQ16586 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SGCAQ16586 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SGCAQ16586 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SGCAQ16586 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SGCAQ16586 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
SGCAQ16586 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
SGCAQ16586 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.46
SGCAQ16586 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
SGCAQ16586 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SGCAQ16586 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SGCAQ16586 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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SGCAQ16586 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
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SGCAQ16586 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SGCAQ16586 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
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SGCAQ16586 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SGCAQ16586 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SGCAQ16586 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SGCAQ16586 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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SGCAQ16586 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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SGCAQ16586 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SGCAQ16586 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SGCAQ16586 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
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SGCAQ16586 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SGCAQ16586 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGCAQ16586 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGCAQ16586 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGCAQ16586 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGCAQ16586 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGCAQ16586 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGCAQ16586 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGCAQ16586 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGCAQ16586 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGCAQ16586 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGCAQ16586 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGCAQ16586 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGCAQ16586 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGCAQ16586 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGCAQ16586 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGCAQ16586 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGCAQ16586 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGCAQ16586 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGCAQ16586 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGCAQ16586 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGCAQ16586 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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