Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNXAQ16473 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNXAQ16473 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNXAQ16473 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TNXAQ16473 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNXAQ16473 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNXAQ16473 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNXAQ16473 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNXAQ16473 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNXAQ16473 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNXAQ16473 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNXAQ16473 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNXAQ16473 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNXAQ16473 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNXAQ16473 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNXAQ16473 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNXAQ16473 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNXAQ16473 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNXAQ16473 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNXAQ16473 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNXAQ16473 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNXAQ16473 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNXAQ16473 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNXAQ16473 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNXAQ16473 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNXAQ16473 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNXAQ16473 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNXAQ16473 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNXAQ16473 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNXAQ16473 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNXAQ16473 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNXAQ16473 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNXAQ16473 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNXAQ16473 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
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TNXAQ16473 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNXAQ16473 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNXAQ16473 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNXAQ16473 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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TNXAQ16473 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNXAQ16473 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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TNXAQ16473 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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TNXAQ16473 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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TNXAQ16473 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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TNXAQ16473 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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TNXAQ16473 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNXAQ16473 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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TNXAQ16473 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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TNXAQ16473 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNXAQ16473 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNXAQ16473 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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TNXAQ16473 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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TNXAQ16473 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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TNXAQ16473 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNXAQ16473 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TNXAQ16473 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNXAQ16473 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNXAQ16473 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNXAQ16473 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNXAQ16473 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TNXAQ16473 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNXAQ16473 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNXAQ16473 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNXAQ16473 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNXAQ16473 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNXAQ16473 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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