Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABRA6Q16445 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABRA6Q16445 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABRA6Q16445 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABRA6Q16445 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABRA6Q16445 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABRA6Q16445 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABRA6Q16445 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABRA6Q16445 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABRA6Q16445 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABRA6Q16445 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GABRA6Q16445 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABRA6Q16445 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABRA6Q16445 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GABRA6Q16445 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABRA6Q16445 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABRA6Q16445 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABRA6Q16445 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABRA6Q16445 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABRA6Q16445 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABRA6Q16445 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABRA6Q16445 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABRA6Q16445 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABRA6Q16445 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABRA6Q16445 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABRA6Q16445 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABRA6Q16445 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABRA6Q16445 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABRA6Q16445 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABRA6Q16445 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABRA6Q16445 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABRA6Q16445 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GABRA6Q16445 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABRA6Q16445 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABRA6Q16445 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABRA6Q16445 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABRA6Q16445 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABRA6Q16445 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABRA6Q16445 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABRA6Q16445 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABRA6Q16445 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABRA6Q16445 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABRA6Q16445 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABRA6Q16445 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABRA6Q16445 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABRA6Q16445 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABRA6Q16445 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GABRA6Q16445 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
GABRA6Q16445 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GABRA6Q16445 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GABRA6Q16445 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GABRA6Q16445 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GABRA6Q16445 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GABRA6Q16445 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GABRA6Q16445 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GABRA6Q16445 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GABRA6Q16445 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GABRA6Q16445 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GABRA6Q16445 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GABRA6Q16445 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GABRA6Q16445 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GABRA6Q16445 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
GABRA6Q16445 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GABRA6Q16445 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
GABRA6Q16445 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GABRA6Q16445 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GABRA6Q16445 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GABRA6Q16445 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GABRA6Q16445 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GABRA6Q16445 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
GABRA6Q16445 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GABRA6Q16445 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
GABRA6Q16445 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GABRA6Q16445 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GABRA6Q16445 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GABRA6Q16445 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GABRA6Q16445 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GABRA6Q16445 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GABRA6Q16445 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GABRA6Q16445 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GABRA6Q16445 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GABRA6Q16445 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GABRA6Q16445 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GABRA6Q16445 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GABRA6Q16445 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GABRA6Q16445 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GABRA6Q16445 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GABRA6Q16445 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
GABRA6Q16445 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
GABRA6Q16445 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
GABRA6Q16445 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GABRA6Q16445 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GABRA6Q16445 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GABRA6Q16445 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GABRA6Q16445 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GABRA6Q16445 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GABRA6Q16445 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GABRA6Q16445 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GABRA6Q16445 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GABRA6Q16445 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
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