Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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