Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
USF2Q15853 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
USF2Q15853 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
USF2Q15853 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
USF2Q15853 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
USF2Q15853 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
USF2Q15853 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
USF2Q15853 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
USF2Q15853 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
USF2Q15853 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
USF2Q15853 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
USF2Q15853 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
USF2Q15853 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
USF2Q15853 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
USF2Q15853 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
USF2Q15853 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
USF2Q15853 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
USF2Q15853 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
USF2Q15853 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
USF2Q15853 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
USF2Q15853 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
USF2Q15853 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
USF2Q15853 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
USF2Q15853 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
USF2Q15853 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
USF2Q15853 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
USF2Q15853 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
USF2Q15853 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
USF2Q15853 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
USF2Q15853 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
USF2Q15853 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
USF2Q15853 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
USF2Q15853 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
USF2Q15853 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
USF2Q15853 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
USF2Q15853 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
USF2Q15853 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
USF2Q15853 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
USF2Q15853 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
USF2Q15853 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
USF2Q15853 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
USF2Q15853 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
USF2Q15853 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
USF2Q15853 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
USF2Q15853 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
USF2Q15853 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
USF2Q15853 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
USF2Q15853 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
USF2Q15853 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
USF2Q15853 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
USF2Q15853 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
USF2Q15853 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
USF2Q15853 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
USF2Q15853 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
USF2Q15853 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
USF2Q15853 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
USF2Q15853 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
USF2Q15853 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
USF2Q15853 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
USF2Q15853 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
USF2Q15853 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
USF2Q15853 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USF2Q15853 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USF2Q15853 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USF2Q15853 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USF2Q15853 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USF2Q15853 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USF2Q15853 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USF2Q15853 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USF2Q15853 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USF2Q15853 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USF2Q15853 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USF2Q15853 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USF2Q15853 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USF2Q15853 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USF2Q15853 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USF2Q15853 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USF2Q15853 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USF2Q15853 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USF2Q15853 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USF2Q15853 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
USF2Q15853 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USF2Q15853 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USF2Q15853 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USF2Q15853 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USF2Q15853 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USF2Q15853 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USF2Q15853 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USF2Q15853 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USF2Q15853 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USF2Q15853 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USF2Q15853 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USF2Q15853 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USF2Q15853 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USF2Q15853 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USF2Q15853 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USF2Q15853 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USF2Q15853 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USF2Q15853 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USF2Q15853 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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