Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHRNA2Q15822 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHRNA2Q15822 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHRNA2Q15822 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHRNA2Q15822 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHRNA2Q15822 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHRNA2Q15822 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHRNA2Q15822 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHRNA2Q15822 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHRNA2Q15822 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHRNA2Q15822 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHRNA2Q15822 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHRNA2Q15822 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHRNA2Q15822 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHRNA2Q15822 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CHRNA2Q15822 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CHRNA2Q15822 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CHRNA2Q15822 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CHRNA2Q15822 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CHRNA2Q15822 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CHRNA2Q15822 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CHRNA2Q15822 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CHRNA2Q15822 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CHRNA2Q15822 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CHRNA2Q15822 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CHRNA2Q15822 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CHRNA2Q15822 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHRNA2Q15822 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHRNA2Q15822 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHRNA2Q15822 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHRNA2Q15822 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHRNA2Q15822 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHRNA2Q15822 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHRNA2Q15822 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHRNA2Q15822 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHRNA2Q15822 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHRNA2Q15822 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHRNA2Q15822 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHRNA2Q15822 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHRNA2Q15822 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHRNA2Q15822 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHRNA2Q15822 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHRNA2Q15822 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHRNA2Q15822 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHRNA2Q15822 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHRNA2Q15822 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHRNA2Q15822 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHRNA2Q15822 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHRNA2Q15822 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHRNA2Q15822 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHRNA2Q15822 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHRNA2Q15822 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHRNA2Q15822 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHRNA2Q15822 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHRNA2Q15822 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHRNA2Q15822 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHRNA2Q15822 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CHRNA2Q15822 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHRNA2Q15822 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CHRNA2Q15822 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHRNA2Q15822 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHRNA2Q15822 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHRNA2Q15822 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHRNA2Q15822 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHRNA2Q15822 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHRNA2Q15822 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHRNA2Q15822 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHRNA2Q15822 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHRNA2Q15822 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHRNA2Q15822 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHRNA2Q15822 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHRNA2Q15822 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHRNA2Q15822 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHRNA2Q15822 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHRNA2Q15822 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHRNA2Q15822 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHRNA2Q15822 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHRNA2Q15822 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHRNA2Q15822 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHRNA2Q15822 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHRNA2Q15822 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHRNA2Q15822 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHRNA2Q15822 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHRNA2Q15822 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHRNA2Q15822 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHRNA2Q15822 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CHRNA2Q15822 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHRNA2Q15822 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHRNA2Q15822 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHRNA2Q15822 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHRNA2Q15822 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHRNA2Q15822 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHRNA2Q15822 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHRNA2Q15822 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHRNA2Q15822 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHRNA2Q15822 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHRNA2Q15822 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CHRNA2Q15822 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CHRNA2Q15822 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CHRNA2Q15822 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms