Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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