Protein–RNA interactions for Protein: Q15629

TRAM1, Translocating chain-associated membrane protein 1, humanhuman

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM1Q15629 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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