Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms