Protein–RNA interactions for Protein: Q15139

PRKD1, Serine/threonine-protein kinase D1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD1Q15139 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PRKD1Q15139 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
PRKD1Q15139 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PRKD1Q15139 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PRKD1Q15139 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PRKD1Q15139 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PRKD1Q15139 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PRKD1Q15139 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PRKD1Q15139 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
PRKD1Q15139 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PRKD1Q15139 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PRKD1Q15139 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PRKD1Q15139 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PRKD1Q15139 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PRKD1Q15139 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PRKD1Q15139 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PRKD1Q15139 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PRKD1Q15139 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PRKD1Q15139 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PRKD1Q15139 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
PRKD1Q15139 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PRKD1Q15139 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PRKD1Q15139 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PRKD1Q15139 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PRKD1Q15139 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PRKD1Q15139 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PRKD1Q15139 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PRKD1Q15139 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PRKD1Q15139 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PRKD1Q15139 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PRKD1Q15139 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PRKD1Q15139 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PRKD1Q15139 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PRKD1Q15139 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PRKD1Q15139 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PRKD1Q15139 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PRKD1Q15139 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PRKD1Q15139 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PRKD1Q15139 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PRKD1Q15139 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PRKD1Q15139 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PRKD1Q15139 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PRKD1Q15139 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PRKD1Q15139 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PRKD1Q15139 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PRKD1Q15139 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PRKD1Q15139 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PRKD1Q15139 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PRKD1Q15139 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PRKD1Q15139 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PRKD1Q15139 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PRKD1Q15139 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PRKD1Q15139 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PRKD1Q15139 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PRKD1Q15139 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PRKD1Q15139 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PRKD1Q15139 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PRKD1Q15139 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PRKD1Q15139 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PRKD1Q15139 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PRKD1Q15139 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PRKD1Q15139 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PRKD1Q15139 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PRKD1Q15139 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PRKD1Q15139 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PRKD1Q15139 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PRKD1Q15139 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PRKD1Q15139 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PRKD1Q15139 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PRKD1Q15139 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRKD1Q15139 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRKD1Q15139 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRKD1Q15139 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRKD1Q15139 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRKD1Q15139 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRKD1Q15139 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRKD1Q15139 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PRKD1Q15139 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRKD1Q15139 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRKD1Q15139 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRKD1Q15139 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRKD1Q15139 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRKD1Q15139 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRKD1Q15139 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRKD1Q15139 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRKD1Q15139 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PRKD1Q15139 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRKD1Q15139 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRKD1Q15139 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRKD1Q15139 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRKD1Q15139 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRKD1Q15139 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRKD1Q15139 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRKD1Q15139 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRKD1Q15139 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRKD1Q15139 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRKD1Q15139 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRKD1Q15139 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRKD1Q15139 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PRKD1Q15139 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms