Protein–RNA interactions for Protein: Q15120

PDK3, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK3Q15120 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDK3Q15120 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDK3Q15120 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PDK3Q15120 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDK3Q15120 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDK3Q15120 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDK3Q15120 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDK3Q15120 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDK3Q15120 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDK3Q15120 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDK3Q15120 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDK3Q15120 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDK3Q15120 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDK3Q15120 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDK3Q15120 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDK3Q15120 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PDK3Q15120 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDK3Q15120 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDK3Q15120 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PDK3Q15120 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDK3Q15120 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDK3Q15120 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDK3Q15120 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDK3Q15120 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDK3Q15120 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDK3Q15120 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDK3Q15120 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDK3Q15120 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDK3Q15120 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDK3Q15120 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDK3Q15120 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDK3Q15120 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDK3Q15120 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDK3Q15120 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDK3Q15120 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDK3Q15120 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDK3Q15120 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PDK3Q15120 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDK3Q15120 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDK3Q15120 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDK3Q15120 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PDK3Q15120 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PDK3Q15120 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDK3Q15120 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDK3Q15120 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDK3Q15120 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDK3Q15120 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDK3Q15120 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDK3Q15120 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDK3Q15120 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDK3Q15120 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDK3Q15120 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDK3Q15120 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDK3Q15120 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDK3Q15120 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDK3Q15120 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDK3Q15120 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDK3Q15120 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDK3Q15120 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDK3Q15120 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDK3Q15120 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDK3Q15120 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDK3Q15120 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDK3Q15120 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDK3Q15120 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDK3Q15120 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDK3Q15120 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDK3Q15120 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDK3Q15120 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDK3Q15120 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDK3Q15120 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PDK3Q15120 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDK3Q15120 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDK3Q15120 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDK3Q15120 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDK3Q15120 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDK3Q15120 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDK3Q15120 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDK3Q15120 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDK3Q15120 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDK3Q15120 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDK3Q15120 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDK3Q15120 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDK3Q15120 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDK3Q15120 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDK3Q15120 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDK3Q15120 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDK3Q15120 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDK3Q15120 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDK3Q15120 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDK3Q15120 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDK3Q15120 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDK3Q15120 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDK3Q15120 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PDK3Q15120 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDK3Q15120 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PDK3Q15120 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PDK3Q15120 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PDK3Q15120 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDK3Q15120 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
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