Protein–RNA interactions for Protein: Q14684

RRP1B, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 758 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1BQ14684 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RRP1BQ14684 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RRP1BQ14684 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RRP1BQ14684 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RRP1BQ14684 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RRP1BQ14684 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
RRP1BQ14684 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RRP1BQ14684 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RRP1BQ14684 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RRP1BQ14684 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RRP1BQ14684 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RRP1BQ14684 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RRP1BQ14684 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RRP1BQ14684 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RRP1BQ14684 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RRP1BQ14684 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RRP1BQ14684 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RRP1BQ14684 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RRP1BQ14684 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RRP1BQ14684 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RRP1BQ14684 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RRP1BQ14684 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RRP1BQ14684 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RRP1BQ14684 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RRP1BQ14684 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RRP1BQ14684 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RRP1BQ14684 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RRP1BQ14684 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RRP1BQ14684 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RRP1BQ14684 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RRP1BQ14684 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RRP1BQ14684 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RRP1BQ14684 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RRP1BQ14684 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RRP1BQ14684 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RRP1BQ14684 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RRP1BQ14684 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RRP1BQ14684 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RRP1BQ14684 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RRP1BQ14684 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RRP1BQ14684 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RRP1BQ14684 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RRP1BQ14684 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RRP1BQ14684 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RRP1BQ14684 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RRP1BQ14684 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RRP1BQ14684 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RRP1BQ14684 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RRP1BQ14684 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RRP1BQ14684 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RRP1BQ14684 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RRP1BQ14684 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RRP1BQ14684 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RRP1BQ14684 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RRP1BQ14684 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RRP1BQ14684 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RRP1BQ14684 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RRP1BQ14684 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RRP1BQ14684 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RRP1BQ14684 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RRP1BQ14684 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RRP1BQ14684 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RRP1BQ14684 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RRP1BQ14684 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RRP1BQ14684 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RRP1BQ14684 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RRP1BQ14684 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RRP1BQ14684 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RRP1BQ14684 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RRP1BQ14684 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RRP1BQ14684 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RRP1BQ14684 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RRP1BQ14684 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RRP1BQ14684 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RRP1BQ14684 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RRP1BQ14684 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RRP1BQ14684 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RRP1BQ14684 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RRP1BQ14684 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RRP1BQ14684 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RRP1BQ14684 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RRP1BQ14684 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RRP1BQ14684 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RRP1BQ14684 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RRP1BQ14684 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RRP1BQ14684 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RRP1BQ14684 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RRP1BQ14684 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RRP1BQ14684 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RRP1BQ14684 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RRP1BQ14684 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RRP1BQ14684 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RRP1BQ14684 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RRP1BQ14684 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RRP1BQ14684 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RRP1BQ14684 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RRP1BQ14684 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RRP1BQ14684 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RRP1BQ14684 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RRP1BQ14684 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
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