Protein–RNA interactions for Protein: Q14676

MDC1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDC1Q14676 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MDC1Q14676 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MDC1Q14676 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MDC1Q14676 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MDC1Q14676 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
MDC1Q14676 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MDC1Q14676 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MDC1Q14676 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MDC1Q14676 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MDC1Q14676 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MDC1Q14676 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MDC1Q14676 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MDC1Q14676 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MDC1Q14676 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
MDC1Q14676 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MDC1Q14676 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MDC1Q14676 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MDC1Q14676 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MDC1Q14676 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MDC1Q14676 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MDC1Q14676 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MDC1Q14676 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MDC1Q14676 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MDC1Q14676 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MDC1Q14676 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MDC1Q14676 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MDC1Q14676 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
MDC1Q14676 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MDC1Q14676 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MDC1Q14676 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MDC1Q14676 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MDC1Q14676 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MDC1Q14676 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MDC1Q14676 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MDC1Q14676 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MDC1Q14676 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MDC1Q14676 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MDC1Q14676 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MDC1Q14676 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MDC1Q14676 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MDC1Q14676 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MDC1Q14676 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MDC1Q14676 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MDC1Q14676 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MDC1Q14676 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MDC1Q14676 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MDC1Q14676 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
MDC1Q14676 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
MDC1Q14676 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MDC1Q14676 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MDC1Q14676 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MDC1Q14676 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MDC1Q14676 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MDC1Q14676 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
MDC1Q14676 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MDC1Q14676 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MDC1Q14676 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MDC1Q14676 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MDC1Q14676 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
MDC1Q14676 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MDC1Q14676 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MDC1Q14676 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MDC1Q14676 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MDC1Q14676 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MDC1Q14676 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MDC1Q14676 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MDC1Q14676 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
MDC1Q14676 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MDC1Q14676 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MDC1Q14676 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
MDC1Q14676 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MDC1Q14676 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MDC1Q14676 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MDC1Q14676 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MDC1Q14676 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MDC1Q14676 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MDC1Q14676 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MDC1Q14676 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MDC1Q14676 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MDC1Q14676 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MDC1Q14676 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
MDC1Q14676 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MDC1Q14676 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MDC1Q14676 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MDC1Q14676 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MDC1Q14676 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MDC1Q14676 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MDC1Q14676 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MDC1Q14676 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MDC1Q14676 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MDC1Q14676 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MDC1Q14676 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MDC1Q14676 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MDC1Q14676 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MDC1Q14676 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MDC1Q14676 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MDC1Q14676 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MDC1Q14676 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MDC1Q14676 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MDC1Q14676 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
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