Protein–RNA interactions for Protein: Q14671

PUM1, Pumilio homolog 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM1Q14671 SAP18-206ENST00000492245 405 ntTSL 46.81□□□□□ -1.329e-7■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 NAP1L4-216ENST00000528968 587 ntTSL 56.65□□□□□ -1.347e-12■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 SF3B2-205ENST00000526653 329 ntTSL 26.35□□□□□ -1.391e-15■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 MTOR-202ENST00000376838 4017 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.479e-7■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 TM9SF3-202ENST00000443638 868 ntTSL 35.79□□□□□ -1.481e-8■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 NAP1L4-202ENST00000399614 594 ntTSL 45.75□□□□□ -1.497e-12■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 PHF20-213ENST00000486408 809 ntTSL 55.57□□□□□ -1.529e-7■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 PHF20-212ENST00000485604 446 ntTSL 35.25□□□□□ -1.579e-7■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 BUD31-209ENST00000496696 585 ntTSL 24.58□□□□□ -1.684e-10■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 C21orf59-207ENST00000458138 863 ntTSL 318.03■□□□□ 0.485e-13■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 PKM-225ENST00000570166 626 ntTSL 26.8□□□□□ -1.321e-6■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 NCL-205ENST00000453992 964 ntTSL 419.04■□□□□ 0.647e-49■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 NCL-203ENST00000417652 568 ntTSL 46.92□□□□□ -1.37e-49■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 NCL-206ENST00000454824 606 ntTSL 36.92□□□□□ -1.37e-49■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 NCL-204ENST00000436894 562 ntTSL 45.02□□□□□ -1.617e-49■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 PDIA4-202ENST00000413966 550 ntTSL 219.83■□□□□ 0.771e-11■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 TNIK-209ENST00000468757 1128 ntTSL 514.64□□□□□ -0.071e-6■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 CANX-205ENST00000502673 1000 ntTSL 512.23□□□□□ -0.451e-7■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 MT-RNR2-201ENST00000387347 1559 ntBASIC5.56□□□□□ -1.521e-323■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 MAN2A2-221ENST00000560451 5124 ntTSL 1 (best)19.15■□□□□ 0.666e-7■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 MAN2A2-206ENST00000558290 1049 ntTSL 519■□□□□ 0.636e-7■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 MAN2A2-223ENST00000560534 361 ntTSL 517.9■□□□□ 0.466e-7■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 MAN2A2-210ENST00000558853 624 ntTSL 317.57■□□□□ 0.46e-7■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 MAN2A2-218ENST00000559999 529 ntTSL 416.49■□□□□ 0.236e-7■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.166e-7■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 MAN2A2-204ENST00000558161 4918 ntTSL 1 (best)11.98□□□□□ -0.496e-7■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 IK-202ENST00000502899 690 ntTSL 35.28□□□□□ -1.563e-8■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 RBBP6-202ENST00000348022 5739 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.672e-6■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 RBBP6-203ENST00000381039 3384 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.682e-6■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 H2AFZ-203ENST00000511319 1254 ntTSL 1 (best)30.28■■■□□ 2.448e-12■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 H2AFZ-202ENST00000511203 1880 ntTSL 227.73■■■□□ 2.038e-12■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.488e-12■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 EXO1-203ENST00000423131 950 ntTSL 517.87■□□□□ 0.451e-6■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 NAE1-218ENST00000567743 1460 ntTSL 1 (best)17.85■□□□□ 0.451e-6■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 NDUFC1-204ENST00000503453 682 ntTSL 317.63■□□□□ 0.411e-6■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.341e-6■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 G3BP2-206ENST00000503660 1071 ntTSL 516.82■□□□□ 0.281e-6■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 FUBP1-204ENST00000421641 802 ntTSL 516.41■□□□□ 0.221e-6■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 G3BP2-219ENST00000515457 560 ntTSL 416.07■□□□□ 0.161e-6■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 G3BP2-205ENST00000502654 546 ntTSL 416.07■□□□□ 0.161e-6■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.081e-6■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.041e-6■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.011e-6■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 NDUFC1-202ENST00000394225 664 ntTSL 214.96□□□□□ -0.011e-6■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.051e-6■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.11e-6■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.11e-6■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.111e-6■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 G3BP2-218ENST00000513927 426 ntTSL 314.05□□□□□ -0.161e-6■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 UTP11-202ENST00000483182 573 ntTSL 313.82□□□□□ -0.21e-6■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.221e-6■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 CNBP-202ENST00000441626 1040 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.231e-6■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 CNBP-207ENST00000502976 1626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.31e-6■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.331e-6■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.331e-6■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 H2AFZ-204ENST00000511348 1843 ntTSL 1 (best)12.72□□□□□ -0.378e-12■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 NDUFC1-206ENST00000505036 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.391e-6■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 CNBP-206ENST00000502372 1026 ntTSL 511.9□□□□□ -0.51e-6■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 G3BP2-208ENST00000507252 567 ntTSL 411.46□□□□□ -0.571e-6■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 BOD1L1-204ENST00000507943 1128 ntTSL 311.2□□□□□ -0.621e-6■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 H2AFZ-206ENST00000529158 726 ntTSL 311.04□□□□□ -0.648e-12■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 EXO1-210ENST00000519225 583 ntTSL 410.71□□□□□ -0.691e-6■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 BOD1L1-201ENST00000040738 10565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.71e-6■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 NDUFC1-205ENST00000503997 628 ntTSL 310.63□□□□□ -0.711e-6■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 G3BP2-217ENST00000511868 573 ntTSL 210.17□□□□□ -0.781e-6■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 EXO1-207ENST00000493702 783 ntTSL 510.02□□□□□ -0.811e-6■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 UTP11-201ENST00000373014 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.881e-6■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 G3BP2-214ENST00000509561 559 ntTSL 48.87□□□□□ -0.991e-6■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 ISY1-206ENST00000485703 837 ntTSL 57.65□□□□□ -1.181e-6■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 G3BP2-210ENST00000507745 584 ntTSL 47.51□□□□□ -1.211e-6■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 G3BP2-211ENST00000507947 665 ntTSL 27.48□□□□□ -1.211e-6■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 G3BP2-216ENST00000511146 577 ntTSL 37.43□□□□□ -1.221e-6■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 BOD1L1-203ENST00000505343 1202 ntTSL 37.33□□□□□ -1.241e-6■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 EXO1-212ENST00000523590 621 ntTSL 56.79□□□□□ -1.321e-6■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 G3BP2-213ENST00000509100 514 ntTSL 56.62□□□□□ -1.351e-6■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 EXO1-204ENST00000437497 593 ntTSL 36.58□□□□□ -1.361e-6■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 CLTC-211ENST00000579815 609 ntTSL 56.14□□□□□ -1.431e-6■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 NAE1-211ENST00000563253 566 ntTSL 36.11□□□□□ -1.431e-6■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 EXO1-205ENST00000450748 607 ntTSL 35.54□□□□□ -1.521e-6■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 UTP11-204ENST00000488453 1895 ntTSL 24.96□□□□□ -1.621e-6■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 G3BP2-215ENST00000510902 338 ntTSL 34.34□□□□□ -1.711e-6■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 YY1-203ENST00000554371 636 ntTSL 325.43■■□□□ 1.666e-14■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 MYC-203ENST00000517291 1023 ntTSL 1 (best)15.9■□□□□ 0.141e-7■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 YY1-202ENST00000553625 422 ntTSL 218.06■□□□□ 0.483e-7■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 YY1-205ENST00000554804 1114 ntTSL 36.87□□□□□ -1.313e-7■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 PIEZO1-210ENST00000491917 406 ntTSL 224.13■■□□□ 1.455e-9■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 ABCF1-205ENST00000475993 2860 ntTSL 1 (best)9.97□□□□□ -0.812e-11■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 HMG20B-216ENST00000585900 741 ntTSL 319.2■□□□□ 0.663e-6■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 MAP4K4-213ENST00000476609 3598 ntTSL 29.09□□□□□ -0.952e-7■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 DDX24-208ENST00000556635 656 ntTSL 215.66■□□□□ 0.11e-9■□□□□ 11.2
PUM1Q14671 DDX24-210ENST00000622786 1730 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.921e-9■□□□□ 11.2
PUM1Q14671 DDX24-203ENST00000553400 618 ntTSL 38.26□□□□□ -1.091e-9■□□□□ 11.2
PUM1Q14671 DDX24-204ENST00000553451 486 ntTSL 34.59□□□□□ -1.671e-9■□□□□ 11.2
PUM1Q14671 NKAP-204ENST00000482407 763 ntTSL 39.29□□□□□ -0.926e-7■□□□□ 11.2
PUM1Q14671 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.022e-7■□□□□ 11.2
PUM1Q14671 SMNDC1-203ENST00000460483 753 ntTSL 310.66□□□□□ -0.72e-7■□□□□ 11.2
PUM1Q14671 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.612e-7■□□□□ 11.2
PUM1Q14671 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.028e-8■□□□□ 11.2
PUM1Q14671 CANX-202ENST00000452673 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.368e-8■□□□□ 11.2
PUM1Q14671 CANX-209ENST00000504734 2232 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.58e-8■□□□□ 11.2
Retrieved 100 of 12,080 protein–RNA pairs in 233.2 ms