Protein–RNA interactions for Protein: Q14498

RBM39, RNA-binding protein 39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39Q14498 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
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