Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
COL9A3Q14050 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
COL9A3Q14050 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
COL9A3Q14050 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
COL9A3Q14050 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
COL9A3Q14050 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
COL9A3Q14050 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
COL9A3Q14050 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
COL9A3Q14050 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
COL9A3Q14050 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
COL9A3Q14050 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
COL9A3Q14050 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
COL9A3Q14050 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
COL9A3Q14050 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
COL9A3Q14050 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
COL9A3Q14050 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
COL9A3Q14050 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
COL9A3Q14050 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
COL9A3Q14050 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
COL9A3Q14050 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
COL9A3Q14050 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
COL9A3Q14050 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
COL9A3Q14050 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
COL9A3Q14050 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
COL9A3Q14050 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
COL9A3Q14050 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
COL9A3Q14050 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
COL9A3Q14050 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
COL9A3Q14050 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
COL9A3Q14050 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
COL9A3Q14050 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
COL9A3Q14050 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
COL9A3Q14050 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
COL9A3Q14050 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
COL9A3Q14050 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
COL9A3Q14050 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
COL9A3Q14050 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
COL9A3Q14050 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
COL9A3Q14050 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
COL9A3Q14050 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
COL9A3Q14050 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
COL9A3Q14050 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
COL9A3Q14050 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
COL9A3Q14050 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
COL9A3Q14050 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
COL9A3Q14050 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
COL9A3Q14050 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
COL9A3Q14050 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
COL9A3Q14050 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
COL9A3Q14050 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
COL9A3Q14050 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
COL9A3Q14050 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
COL9A3Q14050 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
COL9A3Q14050 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
COL9A3Q14050 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
COL9A3Q14050 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
COL9A3Q14050 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
COL9A3Q14050 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
COL9A3Q14050 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
COL9A3Q14050 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
COL9A3Q14050 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
COL9A3Q14050 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
COL9A3Q14050 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
COL9A3Q14050 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
COL9A3Q14050 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
COL9A3Q14050 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
COL9A3Q14050 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
COL9A3Q14050 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
COL9A3Q14050 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
COL9A3Q14050 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
COL9A3Q14050 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
COL9A3Q14050 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
COL9A3Q14050 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
COL9A3Q14050 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
COL9A3Q14050 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
COL9A3Q14050 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
COL9A3Q14050 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
COL9A3Q14050 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
COL9A3Q14050 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
COL9A3Q14050 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
COL9A3Q14050 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
COL9A3Q14050 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
COL9A3Q14050 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
COL9A3Q14050 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
COL9A3Q14050 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
COL9A3Q14050 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
COL9A3Q14050 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
COL9A3Q14050 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
COL9A3Q14050 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
COL9A3Q14050 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
COL9A3Q14050 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
COL9A3Q14050 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
COL9A3Q14050 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
COL9A3Q14050 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
COL9A3Q14050 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
COL9A3Q14050 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COL9A3Q14050 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
COL9A3Q14050 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COL9A3Q14050 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COL9A3Q14050 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
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