Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms