Protein–RNA interactions for Protein: Q13884

SNTB1, Beta-1-syntrophin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTB1Q13884 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNTB1Q13884 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNTB1Q13884 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNTB1Q13884 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNTB1Q13884 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNTB1Q13884 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNTB1Q13884 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNTB1Q13884 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNTB1Q13884 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNTB1Q13884 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SNTB1Q13884 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNTB1Q13884 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNTB1Q13884 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNTB1Q13884 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNTB1Q13884 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNTB1Q13884 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNTB1Q13884 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNTB1Q13884 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNTB1Q13884 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNTB1Q13884 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNTB1Q13884 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNTB1Q13884 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNTB1Q13884 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNTB1Q13884 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNTB1Q13884 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNTB1Q13884 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNTB1Q13884 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNTB1Q13884 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNTB1Q13884 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNTB1Q13884 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNTB1Q13884 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNTB1Q13884 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNTB1Q13884 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNTB1Q13884 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNTB1Q13884 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNTB1Q13884 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNTB1Q13884 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SNTB1Q13884 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNTB1Q13884 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNTB1Q13884 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNTB1Q13884 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNTB1Q13884 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNTB1Q13884 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNTB1Q13884 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNTB1Q13884 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNTB1Q13884 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNTB1Q13884 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNTB1Q13884 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNTB1Q13884 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNTB1Q13884 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNTB1Q13884 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNTB1Q13884 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNTB1Q13884 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNTB1Q13884 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNTB1Q13884 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNTB1Q13884 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNTB1Q13884 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNTB1Q13884 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNTB1Q13884 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNTB1Q13884 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNTB1Q13884 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SNTB1Q13884 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNTB1Q13884 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNTB1Q13884 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNTB1Q13884 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SNTB1Q13884 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNTB1Q13884 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNTB1Q13884 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNTB1Q13884 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNTB1Q13884 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNTB1Q13884 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNTB1Q13884 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNTB1Q13884 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNTB1Q13884 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNTB1Q13884 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNTB1Q13884 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNTB1Q13884 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNTB1Q13884 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNTB1Q13884 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNTB1Q13884 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNTB1Q13884 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNTB1Q13884 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNTB1Q13884 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNTB1Q13884 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNTB1Q13884 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNTB1Q13884 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.46
SNTB1Q13884 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
SNTB1Q13884 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNTB1Q13884 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNTB1Q13884 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNTB1Q13884 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNTB1Q13884 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNTB1Q13884 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNTB1Q13884 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNTB1Q13884 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNTB1Q13884 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNTB1Q13884 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNTB1Q13884 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNTB1Q13884 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SNTB1Q13884 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms