Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPTAN1Q13813 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPTAN1Q13813 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPTAN1Q13813 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPTAN1Q13813 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPTAN1Q13813 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPTAN1Q13813 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPTAN1Q13813 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPTAN1Q13813 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPTAN1Q13813 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPTAN1Q13813 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SPTAN1Q13813 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SPTAN1Q13813 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPTAN1Q13813 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPTAN1Q13813 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPTAN1Q13813 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPTAN1Q13813 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPTAN1Q13813 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPTAN1Q13813 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPTAN1Q13813 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SPTAN1Q13813 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPTAN1Q13813 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPTAN1Q13813 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPTAN1Q13813 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPTAN1Q13813 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPTAN1Q13813 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPTAN1Q13813 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPTAN1Q13813 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPTAN1Q13813 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPTAN1Q13813 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPTAN1Q13813 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPTAN1Q13813 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPTAN1Q13813 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPTAN1Q13813 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPTAN1Q13813 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPTAN1Q13813 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPTAN1Q13813 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPTAN1Q13813 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPTAN1Q13813 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPTAN1Q13813 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPTAN1Q13813 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPTAN1Q13813 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPTAN1Q13813 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPTAN1Q13813 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPTAN1Q13813 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPTAN1Q13813 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPTAN1Q13813 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPTAN1Q13813 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPTAN1Q13813 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPTAN1Q13813 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPTAN1Q13813 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPTAN1Q13813 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPTAN1Q13813 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPTAN1Q13813 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPTAN1Q13813 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPTAN1Q13813 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPTAN1Q13813 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPTAN1Q13813 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPTAN1Q13813 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPTAN1Q13813 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPTAN1Q13813 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SPTAN1Q13813 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPTAN1Q13813 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SPTAN1Q13813 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPTAN1Q13813 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPTAN1Q13813 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPTAN1Q13813 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPTAN1Q13813 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPTAN1Q13813 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPTAN1Q13813 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPTAN1Q13813 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPTAN1Q13813 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPTAN1Q13813 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPTAN1Q13813 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPTAN1Q13813 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPTAN1Q13813 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPTAN1Q13813 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPTAN1Q13813 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPTAN1Q13813 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPTAN1Q13813 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPTAN1Q13813 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPTAN1Q13813 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPTAN1Q13813 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SPTAN1Q13813 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPTAN1Q13813 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPTAN1Q13813 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPTAN1Q13813 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPTAN1Q13813 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPTAN1Q13813 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPTAN1Q13813 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPTAN1Q13813 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPTAN1Q13813 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPTAN1Q13813 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPTAN1Q13813 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPTAN1Q13813 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPTAN1Q13813 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPTAN1Q13813 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPTAN1Q13813 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPTAN1Q13813 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPTAN1Q13813 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
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