Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CUL4AQ13619 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CUL4AQ13619 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CUL4AQ13619 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CUL4AQ13619 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CUL4AQ13619 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CUL4AQ13619 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CUL4AQ13619 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CUL4AQ13619 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CUL4AQ13619 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CUL4AQ13619 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CUL4AQ13619 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CUL4AQ13619 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CUL4AQ13619 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CUL4AQ13619 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CUL4AQ13619 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CUL4AQ13619 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CUL4AQ13619 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CUL4AQ13619 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CUL4AQ13619 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CUL4AQ13619 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CUL4AQ13619 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CUL4AQ13619 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CUL4AQ13619 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CUL4AQ13619 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CUL4AQ13619 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CUL4AQ13619 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CUL4AQ13619 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CUL4AQ13619 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CUL4AQ13619 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CUL4AQ13619 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CUL4AQ13619 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CUL4AQ13619 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CUL4AQ13619 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CUL4AQ13619 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CUL4AQ13619 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CUL4AQ13619 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CUL4AQ13619 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CUL4AQ13619 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CUL4AQ13619 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CUL4AQ13619 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CUL4AQ13619 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CUL4AQ13619 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CUL4AQ13619 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
CUL4AQ13619 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
CUL4AQ13619 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CUL4AQ13619 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CUL4AQ13619 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CUL4AQ13619 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CUL4AQ13619 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CUL4AQ13619 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CUL4AQ13619 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CUL4AQ13619 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CUL4AQ13619 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CUL4AQ13619 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CUL4AQ13619 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CUL4AQ13619 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CUL4AQ13619 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CUL4AQ13619 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CUL4AQ13619 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CUL4AQ13619 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CUL4AQ13619 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CUL4AQ13619 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CUL4AQ13619 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CUL4AQ13619 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CUL4AQ13619 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CUL4AQ13619 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CUL4AQ13619 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CUL4AQ13619 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CUL4AQ13619 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CUL4AQ13619 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CUL4AQ13619 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CUL4AQ13619 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CUL4AQ13619 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CUL4AQ13619 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CUL4AQ13619 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CUL4AQ13619 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CUL4AQ13619 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CUL4AQ13619 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CUL4AQ13619 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CUL4AQ13619 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CUL4AQ13619 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CUL4AQ13619 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CUL4AQ13619 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CUL4AQ13619 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CUL4AQ13619 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CUL4AQ13619 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CUL4AQ13619 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CUL4AQ13619 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CUL4AQ13619 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CUL4AQ13619 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CUL4AQ13619 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CUL4AQ13619 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CUL4AQ13619 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CUL4AQ13619 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CUL4AQ13619 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CUL4AQ13619 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CUL4AQ13619 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CUL4AQ13619 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CUL4AQ13619 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms