Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
DNASE1L3Q13609 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
DNASE1L3Q13609 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DNASE1L3Q13609 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DNASE1L3Q13609 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DNASE1L3Q13609 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DNASE1L3Q13609 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DNASE1L3Q13609 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DNASE1L3Q13609 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DNASE1L3Q13609 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DNASE1L3Q13609 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
DNASE1L3Q13609 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DNASE1L3Q13609 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DNASE1L3Q13609 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DNASE1L3Q13609 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DNASE1L3Q13609 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DNASE1L3Q13609 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DNASE1L3Q13609 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DNASE1L3Q13609 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DNASE1L3Q13609 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DNASE1L3Q13609 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
DNASE1L3Q13609 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DNASE1L3Q13609 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DNASE1L3Q13609 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DNASE1L3Q13609 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DNASE1L3Q13609 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DNASE1L3Q13609 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DNASE1L3Q13609 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DNASE1L3Q13609 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DNASE1L3Q13609 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DNASE1L3Q13609 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DNASE1L3Q13609 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DNASE1L3Q13609 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DNASE1L3Q13609 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DNASE1L3Q13609 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DNASE1L3Q13609 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DNASE1L3Q13609 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DNASE1L3Q13609 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DNASE1L3Q13609 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DNASE1L3Q13609 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DNASE1L3Q13609 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DNASE1L3Q13609 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DNASE1L3Q13609 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DNASE1L3Q13609 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DNASE1L3Q13609 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DNASE1L3Q13609 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DNASE1L3Q13609 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DNASE1L3Q13609 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DNASE1L3Q13609 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DNASE1L3Q13609 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DNASE1L3Q13609 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DNASE1L3Q13609 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DNASE1L3Q13609 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DNASE1L3Q13609 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DNASE1L3Q13609 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DNASE1L3Q13609 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DNASE1L3Q13609 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DNASE1L3Q13609 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DNASE1L3Q13609 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
DNASE1L3Q13609 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
DNASE1L3Q13609 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
DNASE1L3Q13609 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
DNASE1L3Q13609 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
DNASE1L3Q13609 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
DNASE1L3Q13609 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
DNASE1L3Q13609 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
DNASE1L3Q13609 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
DNASE1L3Q13609 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
DNASE1L3Q13609 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
DNASE1L3Q13609 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
DNASE1L3Q13609 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
DNASE1L3Q13609 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DNASE1L3Q13609 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
DNASE1L3Q13609 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
DNASE1L3Q13609 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
DNASE1L3Q13609 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DNASE1L3Q13609 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
DNASE1L3Q13609 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
DNASE1L3Q13609 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
DNASE1L3Q13609 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DNASE1L3Q13609 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DNASE1L3Q13609 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DNASE1L3Q13609 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
DNASE1L3Q13609 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DNASE1L3Q13609 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DNASE1L3Q13609 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DNASE1L3Q13609 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DNASE1L3Q13609 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
DNASE1L3Q13609 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DNASE1L3Q13609 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
DNASE1L3Q13609 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DNASE1L3Q13609 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DNASE1L3Q13609 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DNASE1L3Q13609 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DNASE1L3Q13609 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DNASE1L3Q13609 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DNASE1L3Q13609 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DNASE1L3Q13609 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DNASE1L3Q13609 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DNASE1L3Q13609 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms