Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATRQ13535 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATRQ13535 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
ATRQ13535 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATRQ13535 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATRQ13535 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATRQ13535 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ATRQ13535 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATRQ13535 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATRQ13535 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATRQ13535 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATRQ13535 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATRQ13535 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATRQ13535 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATRQ13535 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATRQ13535 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ATRQ13535 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATRQ13535 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATRQ13535 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATRQ13535 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATRQ13535 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATRQ13535 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATRQ13535 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATRQ13535 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATRQ13535 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATRQ13535 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATRQ13535 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATRQ13535 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATRQ13535 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATRQ13535 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATRQ13535 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATRQ13535 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATRQ13535 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATRQ13535 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATRQ13535 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATRQ13535 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATRQ13535 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATRQ13535 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ATRQ13535 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ATRQ13535 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATRQ13535 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATRQ13535 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATRQ13535 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ATRQ13535 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATRQ13535 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATRQ13535 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATRQ13535 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATRQ13535 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATRQ13535 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATRQ13535 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATRQ13535 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATRQ13535 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATRQ13535 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATRQ13535 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATRQ13535 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATRQ13535 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATRQ13535 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATRQ13535 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATRQ13535 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATRQ13535 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ATRQ13535 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ATRQ13535 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATRQ13535 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATRQ13535 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATRQ13535 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATRQ13535 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATRQ13535 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATRQ13535 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATRQ13535 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATRQ13535 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATRQ13535 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATRQ13535 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATRQ13535 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATRQ13535 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATRQ13535 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATRQ13535 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATRQ13535 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATRQ13535 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATRQ13535 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATRQ13535 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ATRQ13535 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATRQ13535 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATRQ13535 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATRQ13535 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATRQ13535 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATRQ13535 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATRQ13535 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATRQ13535 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATRQ13535 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATRQ13535 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATRQ13535 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATRQ13535 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATRQ13535 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATRQ13535 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATRQ13535 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATRQ13535 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATRQ13535 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATRQ13535 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ATRQ13535 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATRQ13535 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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