Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRPF4BQ13523 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRPF4BQ13523 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRPF4BQ13523 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
PRPF4BQ13523 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PRPF4BQ13523 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRPF4BQ13523 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRPF4BQ13523 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRPF4BQ13523 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRPF4BQ13523 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRPF4BQ13523 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRPF4BQ13523 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRPF4BQ13523 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRPF4BQ13523 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRPF4BQ13523 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRPF4BQ13523 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRPF4BQ13523 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRPF4BQ13523 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRPF4BQ13523 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRPF4BQ13523 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRPF4BQ13523 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRPF4BQ13523 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRPF4BQ13523 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRPF4BQ13523 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRPF4BQ13523 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRPF4BQ13523 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRPF4BQ13523 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRPF4BQ13523 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PRPF4BQ13523 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRPF4BQ13523 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRPF4BQ13523 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRPF4BQ13523 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRPF4BQ13523 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PRPF4BQ13523 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRPF4BQ13523 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRPF4BQ13523 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PRPF4BQ13523 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRPF4BQ13523 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRPF4BQ13523 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRPF4BQ13523 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRPF4BQ13523 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRPF4BQ13523 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRPF4BQ13523 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRPF4BQ13523 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRPF4BQ13523 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRPF4BQ13523 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRPF4BQ13523 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRPF4BQ13523 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRPF4BQ13523 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRPF4BQ13523 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRPF4BQ13523 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRPF4BQ13523 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRPF4BQ13523 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRPF4BQ13523 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRPF4BQ13523 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRPF4BQ13523 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRPF4BQ13523 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRPF4BQ13523 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRPF4BQ13523 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRPF4BQ13523 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRPF4BQ13523 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRPF4BQ13523 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRPF4BQ13523 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRPF4BQ13523 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRPF4BQ13523 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRPF4BQ13523 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRPF4BQ13523 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRPF4BQ13523 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRPF4BQ13523 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRPF4BQ13523 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRPF4BQ13523 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRPF4BQ13523 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PRPF4BQ13523 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRPF4BQ13523 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRPF4BQ13523 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRPF4BQ13523 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRPF4BQ13523 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRPF4BQ13523 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRPF4BQ13523 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRPF4BQ13523 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRPF4BQ13523 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRPF4BQ13523 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRPF4BQ13523 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRPF4BQ13523 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PRPF4BQ13523 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRPF4BQ13523 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRPF4BQ13523 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRPF4BQ13523 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRPF4BQ13523 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRPF4BQ13523 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRPF4BQ13523 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRPF4BQ13523 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRPF4BQ13523 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRPF4BQ13523 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRPF4BQ13523 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRPF4BQ13523 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRPF4BQ13523 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRPF4BQ13523 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPF4BQ13523 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPF4BQ13523 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
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