Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGB3BPQ13352 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGB3BPQ13352 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGB3BPQ13352 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGB3BPQ13352 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGB3BPQ13352 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGB3BPQ13352 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGB3BPQ13352 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGB3BPQ13352 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGB3BPQ13352 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGB3BPQ13352 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGB3BPQ13352 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGB3BPQ13352 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGB3BPQ13352 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGB3BPQ13352 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGB3BPQ13352 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGB3BPQ13352 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGB3BPQ13352 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGB3BPQ13352 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGB3BPQ13352 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGB3BPQ13352 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGB3BPQ13352 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGB3BPQ13352 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGB3BPQ13352 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGB3BPQ13352 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ITGB3BPQ13352 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ITGB3BPQ13352 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ITGB3BPQ13352 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ITGB3BPQ13352 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ITGB3BPQ13352 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ITGB3BPQ13352 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ITGB3BPQ13352 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ITGB3BPQ13352 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ITGB3BPQ13352 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGB3BPQ13352 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGB3BPQ13352 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGB3BPQ13352 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGB3BPQ13352 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGB3BPQ13352 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGB3BPQ13352 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGB3BPQ13352 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGB3BPQ13352 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGB3BPQ13352 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGB3BPQ13352 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGB3BPQ13352 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGB3BPQ13352 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGB3BPQ13352 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGB3BPQ13352 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGB3BPQ13352 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGB3BPQ13352 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGB3BPQ13352 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGB3BPQ13352 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGB3BPQ13352 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGB3BPQ13352 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGB3BPQ13352 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGB3BPQ13352 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGB3BPQ13352 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGB3BPQ13352 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGB3BPQ13352 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGB3BPQ13352 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGB3BPQ13352 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGB3BPQ13352 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGB3BPQ13352 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGB3BPQ13352 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGB3BPQ13352 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGB3BPQ13352 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGB3BPQ13352 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGB3BPQ13352 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGB3BPQ13352 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGB3BPQ13352 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGB3BPQ13352 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGB3BPQ13352 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGB3BPQ13352 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGB3BPQ13352 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGB3BPQ13352 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGB3BPQ13352 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGB3BPQ13352 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGB3BPQ13352 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGB3BPQ13352 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGB3BPQ13352 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGB3BPQ13352 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGB3BPQ13352 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGB3BPQ13352 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGB3BPQ13352 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGB3BPQ13352 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGB3BPQ13352 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGB3BPQ13352 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGB3BPQ13352 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGB3BPQ13352 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGB3BPQ13352 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGB3BPQ13352 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGB3BPQ13352 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGB3BPQ13352 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGB3BPQ13352 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGB3BPQ13352 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGB3BPQ13352 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGB3BPQ13352 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGB3BPQ13352 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGB3BPQ13352 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGB3BPQ13352 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms