Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
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