Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCGB2A2Q13296 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCGB2A2Q13296 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCGB2A2Q13296 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCGB2A2Q13296 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCGB2A2Q13296 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCGB2A2Q13296 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCGB2A2Q13296 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCGB2A2Q13296 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SCGB2A2Q13296 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCGB2A2Q13296 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCGB2A2Q13296 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCGB2A2Q13296 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCGB2A2Q13296 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCGB2A2Q13296 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCGB2A2Q13296 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCGB2A2Q13296 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCGB2A2Q13296 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCGB2A2Q13296 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCGB2A2Q13296 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCGB2A2Q13296 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCGB2A2Q13296 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCGB2A2Q13296 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCGB2A2Q13296 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCGB2A2Q13296 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCGB2A2Q13296 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCGB2A2Q13296 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCGB2A2Q13296 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCGB2A2Q13296 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCGB2A2Q13296 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCGB2A2Q13296 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCGB2A2Q13296 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCGB2A2Q13296 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SCGB2A2Q13296 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCGB2A2Q13296 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCGB2A2Q13296 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCGB2A2Q13296 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SCGB2A2Q13296 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCGB2A2Q13296 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCGB2A2Q13296 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCGB2A2Q13296 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCGB2A2Q13296 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCGB2A2Q13296 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCGB2A2Q13296 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
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SCGB2A2Q13296 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCGB2A2Q13296 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCGB2A2Q13296 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCGB2A2Q13296 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCGB2A2Q13296 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCGB2A2Q13296 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
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SCGB2A2Q13296 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCGB2A2Q13296 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCGB2A2Q13296 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCGB2A2Q13296 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCGB2A2Q13296 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCGB2A2Q13296 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCGB2A2Q13296 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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SCGB2A2Q13296 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCGB2A2Q13296 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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SCGB2A2Q13296 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCGB2A2Q13296 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCGB2A2Q13296 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCGB2A2Q13296 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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SCGB2A2Q13296 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCGB2A2Q13296 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCGB2A2Q13296 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCGB2A2Q13296 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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SCGB2A2Q13296 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCGB2A2Q13296 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCGB2A2Q13296 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCGB2A2Q13296 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCGB2A2Q13296 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCGB2A2Q13296 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCGB2A2Q13296 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCGB2A2Q13296 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCGB2A2Q13296 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCGB2A2Q13296 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCGB2A2Q13296 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCGB2A2Q13296 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCGB2A2Q13296 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCGB2A2Q13296 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCGB2A2Q13296 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCGB2A2Q13296 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCGB2A2Q13296 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCGB2A2Q13296 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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