Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRSF5Q13243 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRSF5Q13243 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRSF5Q13243 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRSF5Q13243 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRSF5Q13243 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRSF5Q13243 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRSF5Q13243 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRSF5Q13243 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SRSF5Q13243 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRSF5Q13243 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRSF5Q13243 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRSF5Q13243 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRSF5Q13243 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRSF5Q13243 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRSF5Q13243 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRSF5Q13243 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRSF5Q13243 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRSF5Q13243 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRSF5Q13243 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SRSF5Q13243 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRSF5Q13243 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRSF5Q13243 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRSF5Q13243 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRSF5Q13243 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRSF5Q13243 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRSF5Q13243 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRSF5Q13243 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRSF5Q13243 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRSF5Q13243 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRSF5Q13243 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRSF5Q13243 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRSF5Q13243 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRSF5Q13243 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRSF5Q13243 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRSF5Q13243 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SRSF5Q13243 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SRSF5Q13243 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRSF5Q13243 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRSF5Q13243 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRSF5Q13243 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SRSF5Q13243 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRSF5Q13243 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SRSF5Q13243 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRSF5Q13243 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRSF5Q13243 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRSF5Q13243 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRSF5Q13243 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRSF5Q13243 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRSF5Q13243 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRSF5Q13243 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRSF5Q13243 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRSF5Q13243 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRSF5Q13243 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRSF5Q13243 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRSF5Q13243 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SRSF5Q13243 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRSF5Q13243 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRSF5Q13243 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRSF5Q13243 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRSF5Q13243 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRSF5Q13243 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRSF5Q13243 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRSF5Q13243 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRSF5Q13243 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRSF5Q13243 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRSF5Q13243 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRSF5Q13243 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRSF5Q13243 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SRSF5Q13243 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRSF5Q13243 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SRSF5Q13243 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SRSF5Q13243 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SRSF5Q13243 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRSF5Q13243 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRSF5Q13243 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRSF5Q13243 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRSF5Q13243 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRSF5Q13243 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRSF5Q13243 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRSF5Q13243 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRSF5Q13243 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRSF5Q13243 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRSF5Q13243 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRSF5Q13243 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRSF5Q13243 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRSF5Q13243 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRSF5Q13243 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRSF5Q13243 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SRSF5Q13243 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRSF5Q13243 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRSF5Q13243 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRSF5Q13243 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRSF5Q13243 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRSF5Q13243 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRSF5Q13243 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SRSF5Q13243 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRSF5Q13243 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRSF5Q13243 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRSF5Q13243 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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