Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DUSP4Q13115 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
DUSP4Q13115 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DUSP4Q13115 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
DUSP4Q13115 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DUSP4Q13115 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DUSP4Q13115 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DUSP4Q13115 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DUSP4Q13115 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DUSP4Q13115 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DUSP4Q13115 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DUSP4Q13115 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DUSP4Q13115 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DUSP4Q13115 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DUSP4Q13115 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
DUSP4Q13115 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DUSP4Q13115 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DUSP4Q13115 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DUSP4Q13115 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DUSP4Q13115 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
DUSP4Q13115 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DUSP4Q13115 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DUSP4Q13115 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
DUSP4Q13115 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DUSP4Q13115 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DUSP4Q13115 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DUSP4Q13115 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DUSP4Q13115 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DUSP4Q13115 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DUSP4Q13115 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DUSP4Q13115 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DUSP4Q13115 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DUSP4Q13115 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DUSP4Q13115 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
DUSP4Q13115 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DUSP4Q13115 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DUSP4Q13115 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DUSP4Q13115 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DUSP4Q13115 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DUSP4Q13115 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DUSP4Q13115 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DUSP4Q13115 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DUSP4Q13115 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DUSP4Q13115 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DUSP4Q13115 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DUSP4Q13115 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DUSP4Q13115 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DUSP4Q13115 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DUSP4Q13115 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
DUSP4Q13115 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DUSP4Q13115 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DUSP4Q13115 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DUSP4Q13115 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DUSP4Q13115 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DUSP4Q13115 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DUSP4Q13115 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DUSP4Q13115 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DUSP4Q13115 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DUSP4Q13115 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DUSP4Q13115 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
DUSP4Q13115 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
DUSP4Q13115 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DUSP4Q13115 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DUSP4Q13115 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
DUSP4Q13115 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DUSP4Q13115 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DUSP4Q13115 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
DUSP4Q13115 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DUSP4Q13115 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DUSP4Q13115 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DUSP4Q13115 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DUSP4Q13115 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DUSP4Q13115 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DUSP4Q13115 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DUSP4Q13115 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DUSP4Q13115 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DUSP4Q13115 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DUSP4Q13115 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DUSP4Q13115 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DUSP4Q13115 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DUSP4Q13115 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DUSP4Q13115 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DUSP4Q13115 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DUSP4Q13115 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DUSP4Q13115 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DUSP4Q13115 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DUSP4Q13115 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DUSP4Q13115 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DUSP4Q13115 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DUSP4Q13115 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DUSP4Q13115 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DUSP4Q13115 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DUSP4Q13115 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
DUSP4Q13115 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
DUSP4Q13115 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DUSP4Q13115 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DUSP4Q13115 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DUSP4Q13115 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
DUSP4Q13115 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DUSP4Q13115 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
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