Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAF3Q13114 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAF3Q13114 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAF3Q13114 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAF3Q13114 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAF3Q13114 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAF3Q13114 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAF3Q13114 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAF3Q13114 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAF3Q13114 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAF3Q13114 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAF3Q13114 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAF3Q13114 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAF3Q13114 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAF3Q13114 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAF3Q13114 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAF3Q13114 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAF3Q13114 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAF3Q13114 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAF3Q13114 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAF3Q13114 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAF3Q13114 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAF3Q13114 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAF3Q13114 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAF3Q13114 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAF3Q13114 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAF3Q13114 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAF3Q13114 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAF3Q13114 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAF3Q13114 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAF3Q13114 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAF3Q13114 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAF3Q13114 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAF3Q13114 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAF3Q13114 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAF3Q13114 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAF3Q13114 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAF3Q13114 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAF3Q13114 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAF3Q13114 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAF3Q13114 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAF3Q13114 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAF3Q13114 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAF3Q13114 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAF3Q13114 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAF3Q13114 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAF3Q13114 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAF3Q13114 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAF3Q13114 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAF3Q13114 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAF3Q13114 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAF3Q13114 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAF3Q13114 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAF3Q13114 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAF3Q13114 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAF3Q13114 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAF3Q13114 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAF3Q13114 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAF3Q13114 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
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TRAF3Q13114 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAF3Q13114 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAF3Q13114 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAF3Q13114 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAF3Q13114 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAF3Q13114 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
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TRAF3Q13114 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
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TRAF3Q13114 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAF3Q13114 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAF3Q13114 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
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TRAF3Q13114 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAF3Q13114 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAF3Q13114 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
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TRAF3Q13114 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAF3Q13114 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAF3Q13114 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TRAF3Q13114 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TRAF3Q13114 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TRAF3Q13114 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAF3Q13114 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAF3Q13114 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAF3Q13114 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAF3Q13114 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAF3Q13114 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAF3Q13114 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAF3Q13114 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAF3Q13114 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAF3Q13114 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
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