Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

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Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
PRDM2Q13029 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC34.55■■■■□ 3.12
PRDM2Q13029 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
PRDM2Q13029 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
PRDM2Q13029 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
PRDM2Q13029 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
PRDM2Q13029 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
PRDM2Q13029 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
PRDM2Q13029 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
PRDM2Q13029 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
PRDM2Q13029 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
PRDM2Q13029 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
PRDM2Q13029 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
PRDM2Q13029 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC34.54■■■■□ 3.12
PRDM2Q13029 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
PRDM2Q13029 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
PRDM2Q13029 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
PRDM2Q13029 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
PRDM2Q13029 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
PRDM2Q13029 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
PRDM2Q13029 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
PRDM2Q13029 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
PRDM2Q13029 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
PRDM2Q13029 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
PRDM2Q13029 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
PRDM2Q13029 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.53■■■■□ 3.12
PRDM2Q13029 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
PRDM2Q13029 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
PRDM2Q13029 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
PRDM2Q13029 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC34.52■■■■□ 3.12
PRDM2Q13029 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC34.52■■■■□ 3.12
PRDM2Q13029 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
PRDM2Q13029 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
PRDM2Q13029 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
PRDM2Q13029 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
PRDM2Q13029 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
PRDM2Q13029 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
PRDM2Q13029 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
PRDM2Q13029 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
PRDM2Q13029 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
PRDM2Q13029 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
PRDM2Q13029 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
PRDM2Q13029 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC34.52■■■■□ 3.12
PRDM2Q13029 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
PRDM2Q13029 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
PRDM2Q13029 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
PRDM2Q13029 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
PRDM2Q13029 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
PRDM2Q13029 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC34.51■■■■□ 3.12
PRDM2Q13029 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
PRDM2Q13029 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC34.51■■■■□ 3.11
PRDM2Q13029 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
PRDM2Q13029 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
PRDM2Q13029 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
PRDM2Q13029 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
PRDM2Q13029 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
PRDM2Q13029 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
PRDM2Q13029 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
PRDM2Q13029 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
PRDM2Q13029 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
PRDM2Q13029 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
PRDM2Q13029 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
PRDM2Q13029 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
PRDM2Q13029 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
PRDM2Q13029 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
PRDM2Q13029 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.49■■■■□ 3.11
PRDM2Q13029 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
PRDM2Q13029 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
PRDM2Q13029 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.49■■■■□ 3.11
PRDM2Q13029 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
PRDM2Q13029 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
PRDM2Q13029 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
PRDM2Q13029 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
PRDM2Q13029 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
PRDM2Q13029 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
PRDM2Q13029 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
PRDM2Q13029 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC34.48■■■■□ 3.11
PRDM2Q13029 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
PRDM2Q13029 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
PRDM2Q13029 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
PRDM2Q13029 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
PRDM2Q13029 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
PRDM2Q13029 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
PRDM2Q13029 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
PRDM2Q13029 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
PRDM2Q13029 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
PRDM2Q13029 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
PRDM2Q13029 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
PRDM2Q13029 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
PRDM2Q13029 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
PRDM2Q13029 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
PRDM2Q13029 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
PRDM2Q13029 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
PRDM2Q13029 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
PRDM2Q13029 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
PRDM2Q13029 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
PRDM2Q13029 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
PRDM2Q13029 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
PRDM2Q13029 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
PRDM2Q13029 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
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