Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC19■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC19■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC19■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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