Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFX1Q12986 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFX1Q12986 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFX1Q12986 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFX1Q12986 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFX1Q12986 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NFX1Q12986 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFX1Q12986 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFX1Q12986 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFX1Q12986 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFX1Q12986 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFX1Q12986 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFX1Q12986 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFX1Q12986 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFX1Q12986 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFX1Q12986 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFX1Q12986 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NFX1Q12986 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NFX1Q12986 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NFX1Q12986 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NFX1Q12986 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NFX1Q12986 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NFX1Q12986 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NFX1Q12986 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NFX1Q12986 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NFX1Q12986 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NFX1Q12986 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NFX1Q12986 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NFX1Q12986 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NFX1Q12986 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFX1Q12986 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFX1Q12986 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFX1Q12986 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFX1Q12986 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFX1Q12986 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFX1Q12986 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFX1Q12986 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFX1Q12986 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFX1Q12986 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFX1Q12986 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFX1Q12986 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFX1Q12986 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NFX1Q12986 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFX1Q12986 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFX1Q12986 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFX1Q12986 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFX1Q12986 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFX1Q12986 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NFX1Q12986 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFX1Q12986 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NFX1Q12986 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFX1Q12986 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFX1Q12986 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFX1Q12986 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFX1Q12986 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFX1Q12986 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFX1Q12986 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFX1Q12986 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFX1Q12986 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFX1Q12986 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFX1Q12986 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFX1Q12986 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFX1Q12986 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFX1Q12986 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFX1Q12986 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFX1Q12986 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFX1Q12986 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFX1Q12986 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFX1Q12986 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFX1Q12986 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFX1Q12986 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFX1Q12986 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFX1Q12986 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFX1Q12986 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NFX1Q12986 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NFX1Q12986 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFX1Q12986 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFX1Q12986 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFX1Q12986 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFX1Q12986 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFX1Q12986 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFX1Q12986 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFX1Q12986 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFX1Q12986 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFX1Q12986 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFX1Q12986 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFX1Q12986 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFX1Q12986 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFX1Q12986 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NFX1Q12986 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFX1Q12986 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFX1Q12986 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NFX1Q12986 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFX1Q12986 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFX1Q12986 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NFX1Q12986 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFX1Q12986 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFX1Q12986 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFX1Q12986 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFX1Q12986 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
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