Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
STX4Q12846 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
STX4Q12846 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
STX4Q12846 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
STX4Q12846 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
STX4Q12846 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
STX4Q12846 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
STX4Q12846 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
STX4Q12846 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
STX4Q12846 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
STX4Q12846 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
STX4Q12846 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
STX4Q12846 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
STX4Q12846 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
STX4Q12846 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
STX4Q12846 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
STX4Q12846 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
STX4Q12846 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
STX4Q12846 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
STX4Q12846 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
STX4Q12846 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
STX4Q12846 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
STX4Q12846 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
STX4Q12846 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
STX4Q12846 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
STX4Q12846 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
STX4Q12846 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
STX4Q12846 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
STX4Q12846 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
STX4Q12846 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
STX4Q12846 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
STX4Q12846 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
STX4Q12846 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
STX4Q12846 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
STX4Q12846 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
STX4Q12846 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
STX4Q12846 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
STX4Q12846 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
STX4Q12846 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
STX4Q12846 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
STX4Q12846 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
STX4Q12846 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
STX4Q12846 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
STX4Q12846 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
STX4Q12846 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC19■□□□□ 0.63
STX4Q12846 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
STX4Q12846 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
STX4Q12846 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
STX4Q12846 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
STX4Q12846 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
STX4Q12846 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
STX4Q12846 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
STX4Q12846 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
STX4Q12846 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
STX4Q12846 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
STX4Q12846 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
STX4Q12846 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
STX4Q12846 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
STX4Q12846 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
STX4Q12846 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
STX4Q12846 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
STX4Q12846 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
STX4Q12846 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
STX4Q12846 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
STX4Q12846 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
STX4Q12846 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
STX4Q12846 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
STX4Q12846 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
STX4Q12846 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
STX4Q12846 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
STX4Q12846 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
STX4Q12846 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
STX4Q12846 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
STX4Q12846 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
STX4Q12846 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
STX4Q12846 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
STX4Q12846 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
STX4Q12846 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
STX4Q12846 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
STX4Q12846 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
STX4Q12846 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
STX4Q12846 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
STX4Q12846 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
STX4Q12846 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
STX4Q12846 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
STX4Q12846 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
STX4Q12846 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
STX4Q12846 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
STX4Q12846 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
STX4Q12846 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
STX4Q12846 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
STX4Q12846 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
STX4Q12846 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
STX4Q12846 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
STX4Q12846 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
STX4Q12846 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
STX4Q12846 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
STX4Q12846 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
STX4Q12846 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
STX4Q12846 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms