Protein–RNA interactions for Protein: Q12342

LDB17, Protein LDB17, yeastyeast

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LDB17Q12342 ATP6Q0085 780 nt1.31□□□□□ -2.2
LDB17Q12342 IRC23YOR044W 474 nt1.31□□□□□ -2.2
LDB17Q12342 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt1.31□□□□□ -2.2
LDB17Q12342 ENV11YGR071C 2583 nt1.3□□□□□ -2.2
LDB17Q12342 AZF1YOR113W 2745 nt1.3□□□□□ -2.2
LDB17Q12342 YGR035CYGR035C 351 nt1.3□□□□□ -2.2
LDB17Q12342 EMC5YIL027C 426 nt1.3□□□□□ -2.2
LDB17Q12342 YIL059CYIL059C 366 nt1.3□□□□□ -2.2
LDB17Q12342 RPS27AYKL156W 249 nt1.3□□□□□ -2.2
LDB17Q12342 RRT15YLR162W-A 189 nt1.3□□□□□ -2.2
LDB17Q12342 YOR376WYOR376W 369 nt1.3□□□□□ -2.2
LDB17Q12342 YPR016W-AYPR016W-A 261 nt1.3□□□□□ -2.2
LDB17Q12342 RFX1YLR176C 2436 nt1.3□□□□□ -2.2
LDB17Q12342 PBY1YBR094W 2262 nt1.29□□□□□ -2.2
LDB17Q12342 DGR2YKL121W 2559 nt1.29□□□□□ -2.2
LDB17Q12342 PAU2YEL049W 363 nt1.29□□□□□ -2.2
LDB17Q12342 CLU1YMR012W 3834 nt1.29□□□□□ -2.2
LDB17Q12342 YJR003CYJR003C 1560 nt1.29□□□□□ -2.2
LDB17Q12342 YLL032CYLL032C 2478 nt1.28□□□□□ -2.2
LDB17Q12342 snR72snR72 98 nt1.28□□□□□ -2.2
LDB17Q12342 YJL135WYJL135W 318 nt1.28□□□□□ -2.2
LDB17Q12342 MRPL31YKL138C 396 nt1.28□□□□□ -2.2
LDB17Q12342 YAR053WYAR053W 297 nt1.28□□□□□ -2.2
LDB17Q12342 UFD2YDL190C 2886 nt1.27□□□□□ -2.21
LDB17Q12342 SPC98YNL126W 2541 nt1.27□□□□□ -2.21
LDB17Q12342 YGR174W-AYGR174W-A 87 nt1.27□□□□□ -2.21
LDB17Q12342 EFR3YMR212C 2349 nt1.27□□□□□ -2.21
LDB17Q12342 MUK1YPL070W 1839 nt1.26□□□□□ -2.21
LDB17Q12342 ZIP1YDR285W 2628 nt1.26□□□□□ -2.21
LDB17Q12342 CDC36YDL165W 576 nt1.26□□□□□ -2.21
LDB17Q12342 RPS20YHL015W 366 nt1.26□□□□□ -2.21
LDB17Q12342 RPL40BYKR094C 387 nt1.26□□□□□ -2.21
LDB17Q12342 YOR029WYOR029W 336 nt1.26□□□□□ -2.21
LDB17Q12342 RPL33BYOR234C 324 nt1.26□□□□□ -2.21
LDB17Q12342 snR51snR51 107 nt1.26□□□□□ -2.21
LDB17Q12342 RAD50YNL250W 3939 nt1.26□□□□□ -2.21
LDB17Q12342 SGO1YOR073W 1773 nt1.26□□□□□ -2.21
LDB17Q12342 YCS4YLR272C 3531 nt1.26□□□□□ -2.21
LDB17Q12342 RAD9YDR217C 3930 nt1.25□□□□□ -2.21
LDB17Q12342 SWI6YLR182W 2412 nt1.25□□□□□ -2.21
LDB17Q12342 YIL020C-AYIL020C-A 339 nt1.25□□□□□ -2.21
LDB17Q12342 SDH2YLL041C 801 nt1.25□□□□□ -2.21
LDB17Q12342 TIM18YOR297C 579 nt1.25□□□□□ -2.21
LDB17Q12342 snR14snR14 160 nt1.25□□□□□ -2.21
LDB17Q12342 PIG1YLR273C 1947 nt1.25□□□□□ -2.21
LDB17Q12342 YAF9YNL107W 681 nt1.24□□□□□ -2.21
LDB17Q12342 YPL225WYPL225W 441 nt1.24□□□□□ -2.21
LDB17Q12342 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt1.24□□□□□ -2.21
LDB17Q12342 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt1.23□□□□□ -2.21
LDB17Q12342 YOR199WYOR199W 330 nt1.23□□□□□ -2.21
LDB17Q12342 SEC3YER008C 4011 nt1.23□□□□□ -2.21
LDB17Q12342 YLL054CYLL054C 2532 nt1.23□□□□□ -2.21
LDB17Q12342 LAA1YJL207C 6045 nt1.23□□□□□ -2.21
LDB17Q12342 RPL35AYDL191W 363 nt1.22□□□□□ -2.21
LDB17Q12342 YDL211CYDL211C 1119 nt1.22□□□□□ -2.21
LDB17Q12342 YGL217CYGL217C 342 nt1.22□□□□□ -2.21
LDB17Q12342 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt1.22□□□□□ -2.21
LDB17Q12342 APL2YKL135C 2181 nt1.21□□□□□ -2.22
LDB17Q12342 YNL284C-BYNL284C-B 5268 nt1.21□□□□□ -2.22
LDB17Q12342 YPR063CYPR063C 423 nt1.21□□□□□ -2.22
LDB17Q12342 YPR197CYPR197C 564 nt1.21□□□□□ -2.22
LDB17Q12342 CDC39YCR093W 6327 nt1.21□□□□□ -2.22
LDB17Q12342 RPB10YOR210W 213 nt1.2□□□□□ -2.22
LDB17Q12342 SLX4YLR135W 2247 nt1.2□□□□□ -2.22
LDB17Q12342 NST1YNL091W 3723 nt1.19□□□□□ -2.22
LDB17Q12342 YDR426CYDR426C 378 nt1.19□□□□□ -2.22
LDB17Q12342 YHR007C-AYHR007C-A 216 nt1.19□□□□□ -2.22
LDB17Q12342 RPL38YLR325C 237 nt1.19□□□□□ -2.22
LDB17Q12342 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt1.19□□□□□ -2.22
LDB17Q12342 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt1.19□□□□□ -2.22
LDB17Q12342 NUP188YML103C 4968 nt1.19□□□□□ -2.22
LDB17Q12342 INP2YMR163C 2118 nt1.18□□□□□ -2.22
LDB17Q12342 BIL1YOR304C-A 231 nt1.18□□□□□ -2.22
LDB17Q12342 YSY6YBR162W-A 198 nt1.18□□□□□ -2.22
LDB17Q12342 TTI1YKL033W 3117 nt1.18□□□□□ -2.22
LDB17Q12342 YDR102CYDR102C 333 nt1.17□□□□□ -2.22
LDB17Q12342 YML007C-AYML007C-A 111 nt1.17□□□□□ -2.22
LDB17Q12342 YNL058CYNL058C 951 nt1.17□□□□□ -2.22
LDB17Q12342 YOL160WYOL160W 342 nt1.17□□□□□ -2.22
LDB17Q12342 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt1.17□□□□□ -2.22
LDB17Q12342 YGR130CYGR130C 2451 nt1.17□□□□□ -2.22
LDB17Q12342 MPT5YGL178W 2580 nt1.16□□□□□ -2.22
LDB17Q12342 VPS54YDR027C 2670 nt1.16□□□□□ -2.22
LDB17Q12342 YHL046W-AYHL046W-A 327 nt1.16□□□□□ -2.22
LDB17Q12342 YLL020CYLL020C 306 nt1.16□□□□□ -2.22
LDB17Q12342 NUT1YGL151W 3399 nt1.16□□□□□ -2.22
LDB17Q12342 ZIP2YGL249W 2115 nt1.16□□□□□ -2.22
LDB17Q12342 NIP100YPL174C 2607 nt1.16□□□□□ -2.22
LDB17Q12342 SLY1YDR189W 2001 nt1.15□□□□□ -2.22
LDB17Q12342 YDR524W-CYDR524W-C 90 nt1.15□□□□□ -2.23
LDB17Q12342 Q0142Q0142 177 nt1.15□□□□□ -2.23
LDB17Q12342 YAL063C-AYAL063C-A 291 nt1.15□□□□□ -2.23
LDB17Q12342 SAS3YBL052C 2496 nt1.15□□□□□ -2.23
LDB17Q12342 SLD3YGL113W 2007 nt1.15□□□□□ -2.23
LDB17Q12342 NPC2YDL046W 522 nt1.14□□□□□ -2.23
LDB17Q12342 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt1.14□□□□□ -2.23
LDB17Q12342 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt1.14□□□□□ -2.23
LDB17Q12342 SCW11YGL028C 1629 nt1.14□□□□□ -2.23
LDB17Q12342 NOC3YLR002C 1992 nt1.14□□□□□ -2.23
LDB17Q12342 SIP4YJL089W 2490 nt1.13□□□□□ -2.23
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 18.7 ms