Protein–RNA interactions for Protein: Q12297

TAF3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, yeastyeast

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TAF3Q12297 RPS17AYML024W 411 nt2.19□□□□□ -2.06
TAF3Q12297 MCM10YIL150C 1716 nt2.19□□□□□ -2.06
TAF3Q12297 CUL3YGR003W 2235 nt2.18□□□□□ -2.06
TAF3Q12297 ECM12YHR021W-A 456 nt2.18□□□□□ -2.06
TAF3Q12297 RAV1YJR033C 4074 nt2.17□□□□□ -2.06
TAF3Q12297 FKS1YLR342W 5631 nt2.17□□□□□ -2.06
TAF3Q12297 SRP14YDL092W 441 nt2.17□□□□□ -2.06
TAF3Q12297 YHR071C-AYHR071C-A 321 nt2.17□□□□□ -2.06
TAF3Q12297 PAU18YLL064C 363 nt2.17□□□□□ -2.06
TAF3Q12297 YLR154W-AYLR154W-A 186 nt2.17□□□□□ -2.06
TAF3Q12297 YBL012CYBL012C 402 nt2.17□□□□□ -2.06
TAF3Q12297 PAU6YNR076W 363 nt2.17□□□□□ -2.06
TAF3Q12297 YOR345CYOR345C 351 nt2.17□□□□□ -2.06
TAF3Q12297 YCL046WYCL046W 324 nt2.17□□□□□ -2.06
TAF3Q12297 LYS14YDR034C 2373 nt2.17□□□□□ -2.06
TAF3Q12297 SPP41YDR464W 4308 nt2.16□□□□□ -2.06
TAF3Q12297 MGM1YOR211C 2646 nt2.16□□□□□ -2.06
TAF3Q12297 CDC53YDL132W 2448 nt2.16□□□□□ -2.06
TAF3Q12297 EMP24YGL200C 612 nt2.16□□□□□ -2.06
TAF3Q12297 YBL053WYBL053W 375 nt2.16□□□□□ -2.06
TAF3Q12297 MSC6YOR354C 2079 nt2.16□□□□□ -2.06
TAF3Q12297 SPC98YNL126W 2541 nt2.16□□□□□ -2.06
TAF3Q12297 DNA2YHR164C 4569 nt2.15□□□□□ -2.07
TAF3Q12297 NOP14YDL148C 2433 nt2.15□□□□□ -2.07
TAF3Q12297 SEC31YDL195W 3822 nt2.15□□□□□ -2.07
TAF3Q12297 GIP3YPL137C 3831 nt2.15□□□□□ -2.07
TAF3Q12297 VTC3YPL019C 2508 nt2.15□□□□□ -2.07
TAF3Q12297 NEO1YIL048W 3456 nt2.14□□□□□ -2.07
TAF3Q12297 BRE1YDL074C 2103 nt2.14□□□□□ -2.07
TAF3Q12297 YOR072W-BYOR072W-B 162 nt2.14□□□□□ -2.07
TAF3Q12297 IST2YBR086C 2841 nt2.14□□□□□ -2.07
TAF3Q12297 YOR343W-BYOR343W-B 5313 nt2.14□□□□□ -2.07
TAF3Q12297 MNE1YOR350C 1992 nt2.13□□□□□ -2.07
TAF3Q12297 PMP1YCR024C-A 123 nt2.13□□□□□ -2.07
TAF3Q12297 YCR043CYCR043C 384 nt2.13□□□□□ -2.07
TAF3Q12297 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt2.13□□□□□ -2.07
TAF3Q12297 SAP190YKR028W 3102 nt2.13□□□□□ -2.07
TAF3Q12297 SPO21YOL091W 1830 nt2.12□□□□□ -2.07
TAF3Q12297 CHC1YGL206C 4962 nt2.12□□□□□ -2.07
TAF3Q12297 YDL118WYDL118W 381 nt2.12□□□□□ -2.07
TAF3Q12297 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.12□□□□□ -2.07
TAF3Q12297 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.12□□□□□ -2.07
TAF3Q12297 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.12□□□□□ -2.07
TAF3Q12297 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.12□□□□□ -2.07
TAF3Q12297 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.12□□□□□ -2.07
TAF3Q12297 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.12□□□□□ -2.07
TAF3Q12297 RPL33BYOR234C 324 nt2.12□□□□□ -2.07
TAF3Q12297 MET18YIL128W 3099 nt2.12□□□□□ -2.07
TAF3Q12297 NIP100YPL174C 2607 nt2.12□□□□□ -2.07
TAF3Q12297 ZRG8YER033C 3231 nt2.11□□□□□ -2.07
TAF3Q12297 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt2.11□□□□□ -2.07
TAF3Q12297 YEL073CYEL073C 324 nt2.11□□□□□ -2.07
TAF3Q12297 RPL34BYIL052C 366 nt2.11□□□□□ -2.07
TAF3Q12297 SPO75YLL005C 2607 nt2.1□□□□□ -2.07
TAF3Q12297 YIR044CYIR044C 186 nt2.1□□□□□ -2.07
TAF3Q12297 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt2.1□□□□□ -2.07
TAF3Q12297 USO1YDL058W 5373 nt2.09□□□□□ -2.07
TAF3Q12297 RLM1YPL089C 2031 nt2.09□□□□□ -2.07
TAF3Q12297 SIR4YDR227W 4077 nt2.09□□□□□ -2.07
TAF3Q12297 ATP7YKL016C 525 nt2.09□□□□□ -2.07
TAF3Q12297 PRP42YDR235W 1635 nt2.09□□□□□ -2.08
TAF3Q12297 PUT3YKL015W 2940 nt2.08□□□□□ -2.08
TAF3Q12297 RPS25BYLR333C 327 nt2.08□□□□□ -2.08
TAF3Q12297 YBR174CYBR174C 315 nt2.08□□□□□ -2.08
TAF3Q12297 PDR3YBL005W 2931 nt2.07□□□□□ -2.08
TAF3Q12297 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt2.07□□□□□ -2.08
TAF3Q12297 BPH1YCR032W 6504 nt2.07□□□□□ -2.08
TAF3Q12297 YLL007CYLL007C 1998 nt2.07□□□□□ -2.08
TAF3Q12297 TRL1YJL087C 2484 nt2.07□□□□□ -2.08
TAF3Q12297 IRR1YIL026C 3453 nt2.07□□□□□ -2.08
TAF3Q12297 TFC8YPL007C 1767 nt2.06□□□□□ -2.08
TAF3Q12297 ZRG17YNR039C 1818 nt2.06□□□□□ -2.08
TAF3Q12297 UTP22YGR090W 3714 nt2.06□□□□□ -2.08
TAF3Q12297 YJL120WYJL120W 324 nt2.06□□□□□ -2.08
TAF3Q12297 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt2.06□□□□□ -2.08
TAF3Q12297 ZIP1YDR285W 2628 nt2.06□□□□□ -2.08
TAF3Q12297 ZIP2YGL249W 2115 nt2.06□□□□□ -2.08
TAF3Q12297 HSL1YKL101W 4557 nt2.06□□□□□ -2.08
TAF3Q12297 DCP2YNL118C 2913 nt2.05□□□□□ -2.08
TAF3Q12297 COY1YKL179C 2040 nt2.05□□□□□ -2.08
TAF3Q12297 CAT2YML042W 2013 nt2.05□□□□□ -2.08
TAF3Q12297 BUB1YGR188C 3066 nt2.05□□□□□ -2.08
TAF3Q12297 SAS3YBL052C 2496 nt2.05□□□□□ -2.08
TAF3Q12297 YCR102W-AYCR102W-A 198 nt2.04□□□□□ -2.08
TAF3Q12297 PAU3YCR104W 375 nt2.04□□□□□ -2.08
TAF3Q12297 YDL196WYDL196W 330 nt2.04□□□□□ -2.08
TAF3Q12297 MMS22YLR320W 4365 nt2.04□□□□□ -2.08
TAF3Q12297 KOG1YHR186C 4674 nt2.03□□□□□ -2.08
TAF3Q12297 AGC1YPR021C 2709 nt2.03□□□□□ -2.08
TAF3Q12297 RPL31AYDL075W 342 nt2.03□□□□□ -2.08
TAF3Q12297 TMA7YLR262C-A 195 nt2.03□□□□□ -2.08
TAF3Q12297 RTT101YJL047C 2529 nt2.03□□□□□ -2.08
TAF3Q12297 CDC60YPL160W 3273 nt2.03□□□□□ -2.08
TAF3Q12297 RTT107YHR154W 3213 nt2.03□□□□□ -2.08
TAF3Q12297 TOR2YKL203C 7425 nt2.03□□□□□ -2.08
TAF3Q12297 AHC1YOR023C 1701 nt2.03□□□□□ -2.09
TAF3Q12297 ATG9YDL149W 2994 nt2.02□□□□□ -2.09
TAF3Q12297 PDR8YLR266C 2106 nt2.02□□□□□ -2.09
TAF3Q12297 RAD34YDR314C 2079 nt2.02□□□□□ -2.09
TAF3Q12297 TUS1YLR425W 3924 nt2.02□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 59.3 ms