Protein–RNA interactions for Protein: Q12276

HER1, HMG2-induced ER-remodeling protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HER1Q12276 YOR170WYOR170W 306 nt2.02□□□□□ -2.09
HER1Q12276 PRP39YML046W 1890 nt2.02□□□□□ -2.09
HER1Q12276 TOR2YKL203C 7425 nt2.02□□□□□ -2.09
HER1Q12276 SPT21YMR179W 2277 nt2.01□□□□□ -2.09
HER1Q12276 MGM1YOR211C 2646 nt2.01□□□□□ -2.09
HER1Q12276 PUT3YKL015W 2940 nt2.01□□□□□ -2.09
HER1Q12276 SAP190YKR028W 3102 nt2.01□□□□□ -2.09
HER1Q12276 MGA2YIR033W 3342 nt2.01□□□□□ -2.09
HER1Q12276 MUK1YPL070W 1839 nt2.01□□□□□ -2.09
HER1Q12276 RPH1YER169W 2391 nt2□□□□□ -2.09
HER1Q12276 CAT2YML042W 2013 nt2□□□□□ -2.09
HER1Q12276 INO80YGL150C 4470 nt2□□□□□ -2.09
HER1Q12276 MMS22YLR320W 4365 nt2□□□□□ -2.09
HER1Q12276 VPS54YDR027C 2670 nt2□□□□□ -2.09
HER1Q12276 ELG1YOR144C 2376 nt1.99□□□□□ -2.09
HER1Q12276 RPL42BYHR141C 321 nt1.99□□□□□ -2.09
HER1Q12276 YLR140WYLR140W 327 nt1.99□□□□□ -2.09
HER1Q12276 RPL42AYNL162W 321 nt1.99□□□□□ -2.09
HER1Q12276 YBL083CYBL083C 426 nt1.99□□□□□ -2.09
HER1Q12276 SWI6YLR182W 2412 nt1.99□□□□□ -2.09
HER1Q12276 NEO1YIL048W 3456 nt1.98□□□□□ -2.09
HER1Q12276 IRR1YIL026C 3453 nt1.98□□□□□ -2.09
HER1Q12276 YJL135WYJL135W 318 nt1.98□□□□□ -2.09
HER1Q12276 YPR092WYPR092W 306 nt1.98□□□□□ -2.09
HER1Q12276 HER1YOR227W 3741 nt1.98□□□□□ -2.09
HER1Q12276 SEC31YDL195W 3822 nt1.98□□□□□ -2.09
HER1Q12276 SET2YJL168C 2202 nt1.97□□□□□ -2.09
HER1Q12276 YDR341CYDR341C 1824 nt1.97□□□□□ -2.09
HER1Q12276 RPL37BYDR500C 267 nt1.97□□□□□ -2.09
HER1Q12276 YNL170WYNL170W 396 nt1.97□□□□□ -2.09
HER1Q12276 YOR394C-AYOR394C-A 168 nt1.97□□□□□ -2.09
HER1Q12276 VMR1YHL035C 4779 nt1.97□□□□□ -2.09
HER1Q12276 SLM1YIL105C 2061 nt1.97□□□□□ -2.09
HER1Q12276 SEC5YDR166C 2916 nt1.97□□□□□ -2.09
HER1Q12276 MPT5YGL178W 2580 nt1.97□□□□□ -2.09
HER1Q12276 GCN2YDR283C 4980 nt1.97□□□□□ -2.09
HER1Q12276 ZRG8YER033C 3231 nt1.96□□□□□ -2.1
HER1Q12276 SYH1YPL105C 2550 nt1.96□□□□□ -2.1
HER1Q12276 YOR376WYOR376W 369 nt1.96□□□□□ -2.1
HER1Q12276 YBR182C-AYBR182C-A 195 nt1.96□□□□□ -2.1
HER1Q12276 KOG1YHR186C 4674 nt1.96□□□□□ -2.1
HER1Q12276 UTP22YGR090W 3714 nt1.96□□□□□ -2.1
HER1Q12276 RFX1YLR176C 2436 nt1.96□□□□□ -2.1
HER1Q12276 snR74snR74 88 nt1.95□□□□□ -2.1
HER1Q12276 TMA7YLR262C-A 195 nt1.95□□□□□ -2.1
HER1Q12276 YNL097C-BYNL097C-B 123 nt1.95□□□□□ -2.1
HER1Q12276 RPB10YOR210W 213 nt1.95□□□□□ -2.1
HER1Q12276 CHC1YGL206C 4962 nt1.95□□□□□ -2.1
HER1Q12276 YKU70YMR284W 1809 nt1.94□□□□□ -2.1
HER1Q12276 snR72snR72 98 nt1.94□□□□□ -2.1
HER1Q12276 YHR071C-AYHR071C-A 321 nt1.94□□□□□ -2.1
HER1Q12276 YBL012CYBL012C 402 nt1.94□□□□□ -2.1
HER1Q12276 SWI5YDR146C 2130 nt1.94□□□□□ -2.1
HER1Q12276 SLY1YDR189W 2001 nt1.93□□□□□ -2.1
HER1Q12276 YIR030W-AYIR030W-A 384 nt1.93□□□□□ -2.1
HER1Q12276 NIP100YPL174C 2607 nt1.93□□□□□ -2.1
HER1Q12276 YMR045CYMR045C 5268 nt1.93□□□□□ -2.1
HER1Q12276 AGC1YPR021C 2709 nt1.92□□□□□ -2.1
HER1Q12276 NAM7YMR080C 2916 nt1.92□□□□□ -2.1
HER1Q12276 YCR043CYCR043C 384 nt1.92□□□□□ -2.1
HER1Q12276 YCR087C-AYCR087C-A 462 nt1.92□□□□□ -2.1
HER1Q12276 YGL217CYGL217C 342 nt1.92□□□□□ -2.1
HER1Q12276 YHR073W-AYHR073W-A 177 nt1.92□□□□□ -2.1
HER1Q12276 SGF11YPL047W 300 nt1.92□□□□□ -2.1
HER1Q12276 LYS14YDR034C 2373 nt1.92□□□□□ -2.1
HER1Q12276 BRP1YGL007W 378 nt1.91□□□□□ -2.1
HER1Q12276 PAU18YLL064C 363 nt1.91□□□□□ -2.1
HER1Q12276 PAU6YNR076W 363 nt1.91□□□□□ -2.1
HER1Q12276 PET309YLR067C 2898 nt1.9□□□□□ -2.1
HER1Q12276 SDH6YDR379C-A 240 nt1.9□□□□□ -2.11
HER1Q12276 EMP24YGL200C 612 nt1.9□□□□□ -2.11
HER1Q12276 Q0143Q0143 153 nt1.9□□□□□ -2.11
HER1Q12276 RPS27BYHR021C 249 nt1.9□□□□□ -2.11
HER1Q12276 ANS1YHR126C 480 nt1.9□□□□□ -2.11
HER1Q12276 YOR218CYOR218C 420 nt1.9□□□□□ -2.11
HER1Q12276 snR46snR46 197 nt1.9□□□□□ -2.11
HER1Q12276 SPC98YNL126W 2541 nt1.89□□□□□ -2.11
HER1Q12276 YBR131C-AYBR131C-A 90 nt1.89□□□□□ -2.11
HER1Q12276 SPO75YLL005C 2607 nt1.87□□□□□ -2.11
HER1Q12276 TBS1YBR150C 3285 nt1.87□□□□□ -2.11
HER1Q12276 YCL046WYCL046W 324 nt1.87□□□□□ -2.11
HER1Q12276 SAC3YDR159W 3906 nt1.87□□□□□ -2.11
HER1Q12276 KIP1YBL063W 3336 nt1.86□□□□□ -2.11
HER1Q12276 YNL144CYNL144C 2223 nt1.86□□□□□ -2.11
HER1Q12276 YCR102W-AYCR102W-A 198 nt1.86□□□□□ -2.11
HER1Q12276 SRP14YDL092W 441 nt1.86□□□□□ -2.11
HER1Q12276 UBR2YLR024C 5619 nt1.85□□□□□ -2.11
HER1Q12276 ECM12YHR021W-A 456 nt1.85□□□□□ -2.11
HER1Q12276 MCM10YIL150C 1716 nt1.85□□□□□ -2.11
HER1Q12276 TFC8YPL007C 1767 nt1.85□□□□□ -2.11
HER1Q12276 HSH155YMR288W 2916 nt1.84□□□□□ -2.11
HER1Q12276 YOR343W-BYOR343W-B 5313 nt1.84□□□□□ -2.11
HER1Q12276 HSL1YKL101W 4557 nt1.84□□□□□ -2.11
HER1Q12276 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt1.84□□□□□ -2.11
HER1Q12276 snR52snR52 92 nt1.84□□□□□ -2.11
HER1Q12276 LRE1YCL051W 1752 nt1.84□□□□□ -2.12
HER1Q12276 ZRG17YNR039C 1818 nt1.84□□□□□ -2.12
HER1Q12276 MSC6YOR354C 2079 nt1.84□□□□□ -2.12
HER1Q12276 ULI1YFR026C 510 nt1.83□□□□□ -2.12
HER1Q12276 YGR164WYGR164W 336 nt1.83□□□□□ -2.12
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 69 ms