Protein–RNA interactions for Protein: Q12159

YRA1, RNA annealing protein YRA1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YRA1Q12159 MMS4YBR098W 2076 nt0.66□□□□□ -2.3
YRA1Q12159 SEC1YDR164C 2175 nt0.66□□□□□ -2.3
YRA1Q12159 ILM1YJR118C 612 nt0.65□□□□□ -2.31
YRA1Q12159 YKL068W-AYKL068W-A 237 nt0.65□□□□□ -2.31
YRA1Q12159 OCA6YDR067C 675 nt0.64□□□□□ -2.31
YRA1Q12159 YFL012WYFL012W 447 nt0.64□□□□□ -2.31
YRA1Q12159 tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 73 nt0.64□□□□□ -2.31
YRA1Q12159 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.64□□□□□ -2.31
YRA1Q12159 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.64□□□□□ -2.31
YRA1Q12159 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.64□□□□□ -2.31
YRA1Q12159 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.64□□□□□ -2.31
YRA1Q12159 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.64□□□□□ -2.31
YRA1Q12159 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.64□□□□□ -2.31
YRA1Q12159 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.64□□□□□ -2.31
YRA1Q12159 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.64□□□□□ -2.31
YRA1Q12159 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.64□□□□□ -2.31
YRA1Q12159 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.64□□□□□ -2.31
YRA1Q12159 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.64□□□□□ -2.31
YRA1Q12159 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt0.64□□□□□ -2.31
YRA1Q12159 UPS1YLR193C 528 nt0.64□□□□□ -2.31
YRA1Q12159 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.64□□□□□ -2.31
YRA1Q12159 SWF1YDR126W 1011 nt0.63□□□□□ -2.31
YRA1Q12159 YJR141WYJR141W 1044 nt0.63□□□□□ -2.31
YRA1Q12159 SDH2YLL041C 801 nt0.63□□□□□ -2.31
YRA1Q12159 BUL2YML111W 2763 nt0.62□□□□□ -2.31
YRA1Q12159 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt0.62□□□□□ -2.31
YRA1Q12159 YHR139C-AYHR139C-A 312 nt0.62□□□□□ -2.31
YRA1Q12159 UBX4YMR067C 1251 nt0.62□□□□□ -2.31
YRA1Q12159 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.62□□□□□ -2.31
YRA1Q12159 SLD3YGL113W 2007 nt0.62□□□□□ -2.31
YRA1Q12159 SNU56YDR240C 1479 nt0.61□□□□□ -2.31
YRA1Q12159 PAN2YGL094C 3348 nt0.61□□□□□ -2.31
YRA1Q12159 YDL016CYDL016C 303 nt0.61□□□□□ -2.31
YRA1Q12159 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt0.61□□□□□ -2.31
YRA1Q12159 YPR153WYPR153W 423 nt0.61□□□□□ -2.31
YRA1Q12159 SWI6YLR182W 2412 nt0.6□□□□□ -2.31
YRA1Q12159 LCD1YDR499W 2244 nt0.6□□□□□ -2.31
YRA1Q12159 HUR1YGL168W 333 nt0.6□□□□□ -2.31
YRA1Q12159 YOR218CYOR218C 420 nt0.6□□□□□ -2.31
YRA1Q12159 YLL032CYLL032C 2478 nt0.6□□□□□ -2.31
YRA1Q12159 LTE1YAL024C 4308 nt0.6□□□□□ -2.31
YRA1Q12159 MET32YDR253C 576 nt0.59□□□□□ -2.31
YRA1Q12159 YGR025WYGR025W 303 nt0.59□□□□□ -2.31
YRA1Q12159 YKL123WYKL123W 381 nt0.59□□□□□ -2.31
YRA1Q12159 MRPL31YKL138C 396 nt0.59□□□□□ -2.31
YRA1Q12159 RRT1YBL048W 312 nt0.59□□□□□ -2.31
YRA1Q12159 snR13snR13 124 nt0.59□□□□□ -2.31
YRA1Q12159 TSC3YBR058C-A 243 nt0.59□□□□□ -2.31
YRA1Q12159 AI1Q0050 2505 nt0.58□□□□□ -2.32
YRA1Q12159 ISD11YER048W-A 285 nt0.58□□□□□ -2.32
YRA1Q12159 YER135CYER135C 393 nt0.58□□□□□ -2.32
YRA1Q12159 APQ13YJL075C 417 nt0.58□□□□□ -2.32
YRA1Q12159 RPL32YBL092W 393 nt0.58□□□□□ -2.32
YRA1Q12159 RFX1YLR176C 2436 nt0.58□□□□□ -2.32
YRA1Q12159 YDR029WYDR029W 315 nt0.57□□□□□ -2.32
YRA1Q12159 RCN2YOR220W 798 nt0.57□□□□□ -2.32
YRA1Q12159 SEC8YPR055W 3198 nt0.57□□□□□ -2.32
YRA1Q12159 ALG13YGL047W 609 nt0.56□□□□□ -2.32
YRA1Q12159 YGL239CYGL239C 315 nt0.56□□□□□ -2.32
YRA1Q12159 SLI15YBR156C 2097 nt0.56□□□□□ -2.32
YRA1Q12159 PRP39YML046W 1890 nt0.56□□□□□ -2.32
YRA1Q12159 YER076W-AYER076W-A 348 nt0.55□□□□□ -2.32
YRA1Q12159 RPL38YLR325C 237 nt0.55□□□□□ -2.32
YRA1Q12159 ESP1YGR098C 4893 nt0.55□□□□□ -2.32
YRA1Q12159 DBP6YNR038W 1890 nt0.54□□□□□ -2.32
YRA1Q12159 HMLALPHA2YCL067C 633 nt0.54□□□□□ -2.32
YRA1Q12159 MATALPHA2YCR039C 633 nt0.54□□□□□ -2.32
YRA1Q12159 YDR269CYDR269C 324 nt0.54□□□□□ -2.32
YRA1Q12159 PKH2YOL100W 3246 nt0.54□□□□□ -2.32
YRA1Q12159 WAR1YML076C 2835 nt0.54□□□□□ -2.32
YRA1Q12159 NPC2YDL046W 522 nt0.53□□□□□ -2.32
YRA1Q12159 YER078W-AYER078W-A 165 nt0.53□□□□□ -2.32
YRA1Q12159 YHL042WYHL042W 453 nt0.53□□□□□ -2.32
YRA1Q12159 RPL9AYGL147C 576 nt0.52□□□□□ -2.33
YRA1Q12159 ECM12YHR021W-A 456 nt0.52□□□□□ -2.33
YRA1Q12159 BIG1YHR101C 1008 nt0.52□□□□□ -2.33
YRA1Q12159 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt0.52□□□□□ -2.33
YRA1Q12159 GPI15YNL038W 690 nt0.52□□□□□ -2.33
YRA1Q12159 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt0.51□□□□□ -2.33
YRA1Q12159 YIL066W-AYIL066W-A 444 nt0.51□□□□□ -2.33
YRA1Q12159 IES4YOR189W 351 nt0.51□□□□□ -2.33
YRA1Q12159 ULP2YIL031W 3105 nt0.51□□□□□ -2.33
YRA1Q12159 IQG1YPL242C 4488 nt0.5□□□□□ -2.33
YRA1Q12159 RPS27AYKL156W 249 nt0.5□□□□□ -2.33
YRA1Q12159 EFR3YMR212C 2349 nt0.5□□□□□ -2.33
YRA1Q12159 YML002WYML002W 2214 nt0.5□□□□□ -2.33
YRA1Q12159 ZIP2YGL249W 2115 nt0.5□□□□□ -2.33
YRA1Q12159 YLL007CYLL007C 1998 nt0.49□□□□□ -2.33
YRA1Q12159 YCR001WYCR001W 315 nt0.49□□□□□ -2.33
YRA1Q12159 YGR042WYGR042W 816 nt0.49□□□□□ -2.33
YRA1Q12159 YOR282WYOR282W 321 nt0.49□□□□□ -2.33
YRA1Q12159 YPL182CYPL182C 384 nt0.49□□□□□ -2.33
YRA1Q12159 RPF1YHR088W 888 nt0.48□□□□□ -2.33
YRA1Q12159 YLR269CYLR269C 351 nt0.48□□□□□ -2.33
YRA1Q12159 GEA2YEL022W 4380 nt0.47□□□□□ -2.33
YRA1Q12159 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt0.47□□□□□ -2.33
YRA1Q12159 LOA1YPR139C 903 nt0.47□□□□□ -2.33
YRA1Q12159 GPG1YGL121C 381 nt0.46□□□□□ -2.34
YRA1Q12159 EAF6YJR082C 342 nt0.46□□□□□ -2.34
YRA1Q12159 NFU1YKL040C 771 nt0.46□□□□□ -2.34
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