Protein–RNA interactions for Protein: Q12060

HFI1, Transcriptional coactivator HFI1/ADA1, yeastyeast

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Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HFI1Q12060 SPT21YMR179W 2277 nt2.07□□□□□ -2.08
HFI1Q12060 SEY1YOR165W 2331 nt2.07□□□□□ -2.08
HFI1Q12060 SSS1YDR086C 243 nt2.07□□□□□ -2.08
HFI1Q12060 snR49snR49 165 nt2.07□□□□□ -2.08
HFI1Q12060 MCD1YDL003W 1701 nt2.07□□□□□ -2.08
HFI1Q12060 MSH6YDR097C 3729 nt2.06□□□□□ -2.08
HFI1Q12060 HSH155YMR288W 2916 nt2.06□□□□□ -2.08
HFI1Q12060 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt2.06□□□□□ -2.08
HFI1Q12060 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt2.06□□□□□ -2.08
HFI1Q12060 YOL160WYOL160W 342 nt2.06□□□□□ -2.08
HFI1Q12060 SEC63YOR254C 1992 nt2.06□□□□□ -2.08
HFI1Q12060 ELG1YOR144C 2376 nt2.06□□□□□ -2.08
HFI1Q12060 SEC31YDL195W 3822 nt2.05□□□□□ -2.08
HFI1Q12060 ZIP2YGL249W 2115 nt2.05□□□□□ -2.08
HFI1Q12060 YNL028WYNL028W 318 nt2.05□□□□□ -2.08
HFI1Q12060 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt2.05□□□□□ -2.08
HFI1Q12060 HIR3YJR140C 4947 nt2.05□□□□□ -2.08
HFI1Q12060 BUD2YKL092C 3315 nt2.04□□□□□ -2.08
HFI1Q12060 DGR2YKL121W 2559 nt2.04□□□□□ -2.08
HFI1Q12060 VIK1YPL253C 1944 nt2.03□□□□□ -2.08
HFI1Q12060 CSE2YNR010W 450 nt2.03□□□□□ -2.08
HFI1Q12060 MYO2YOR326W 4725 nt2.03□□□□□ -2.08
HFI1Q12060 NEO1YIL048W 3456 nt2.02□□□□□ -2.09
HFI1Q12060 PDR8YLR266C 2106 nt2.02□□□□□ -2.09
HFI1Q12060 YMR045CYMR045C 5268 nt2.02□□□□□ -2.09
HFI1Q12060 NIP100YPL174C 2607 nt2.02□□□□□ -2.09
HFI1Q12060 APL2YKL135C 2181 nt2.01□□□□□ -2.09
HFI1Q12060 ENV11YGR071C 2583 nt2.01□□□□□ -2.09
HFI1Q12060 ANS1YHR126C 480 nt2.01□□□□□ -2.09
HFI1Q12060 SPC98YNL126W 2541 nt2.01□□□□□ -2.09
HFI1Q12060 MGA2YIR033W 3342 nt2.01□□□□□ -2.09
HFI1Q12060 ATG9YDL149W 2994 nt2.01□□□□□ -2.09
HFI1Q12060 PIG1YLR273C 1947 nt2□□□□□ -2.09
HFI1Q12060 SPG3YDR504C 384 nt2□□□□□ -2.09
HFI1Q12060 YBR064WYBR064W 429 nt2□□□□□ -2.09
HFI1Q12060 SFB2YNL049C 2631 nt1.99□□□□□ -2.09
HFI1Q12060 YMR272W-BYMR272W-B 108 nt1.99□□□□□ -2.09
HFI1Q12060 YOL155W-AYOL155W-A 135 nt1.99□□□□□ -2.09
HFI1Q12060 UBP2YOR124C 3819 nt1.99□□□□□ -2.09
HFI1Q12060 YOR093CYOR093C 4947 nt1.99□□□□□ -2.09
HFI1Q12060 MPT5YGL178W 2580 nt1.99□□□□□ -2.09
HFI1Q12060 MAD1YGL086W 2250 nt1.98□□□□□ -2.09
HFI1Q12060 YCK3YER123W 1575 nt1.98□□□□□ -2.09
HFI1Q12060 NUP192YJL039C 5052 nt1.98□□□□□ -2.09
HFI1Q12060 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt1.98□□□□□ -2.09
HFI1Q12060 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt1.98□□□□□ -2.09
HFI1Q12060 DNF3YMR162C 4971 nt1.98□□□□□ -2.09
HFI1Q12060 YNL144CYNL144C 2223 nt1.97□□□□□ -2.09
HFI1Q12060 snR80snR80 171 nt1.97□□□□□ -2.09
HFI1Q12060 INA22YIR024C 651 nt1.97□□□□□ -2.09
HFI1Q12060 YJL197C-AYJL197C-A 282 nt1.97□□□□□ -2.09
HFI1Q12060 ABF2YMR072W 552 nt1.97□□□□□ -2.09
HFI1Q12060 RAD34YDR314C 2079 nt1.97□□□□□ -2.09
HFI1Q12060 snR55snR55 98 nt1.96□□□□□ -2.1
HFI1Q12060 PAU3YCR104W 375 nt1.96□□□□□ -2.1
HFI1Q12060 PAU2YEL049W 363 nt1.96□□□□□ -2.1
HFI1Q12060 YGL052WYGL052W 306 nt1.96□□□□□ -2.1
HFI1Q12060 RPL34BYIL052C 366 nt1.96□□□□□ -2.1
HFI1Q12060 UTP21YLR409C 2820 nt1.96□□□□□ -2.1
HFI1Q12060 PDE2YOR360C 1581 nt1.95□□□□□ -2.1
HFI1Q12060 YGL041CYGL041C 204 nt1.95□□□□□ -2.1
HFI1Q12060 BPH1YCR032W 6504 nt1.94□□□□□ -2.1
HFI1Q12060 YJR039WYJR039W 3366 nt1.94□□□□□ -2.1
HFI1Q12060 CDC36YDL165W 576 nt1.94□□□□□ -2.1
HFI1Q12060 YLR120W-AYLR120W-A 102 nt1.94□□□□□ -2.1
HFI1Q12060 YOR218CYOR218C 420 nt1.94□□□□□ -2.1
HFI1Q12060 TRM3YDL112W 4311 nt1.94□□□□□ -2.1
HFI1Q12060 UBR2YLR024C 5619 nt1.94□□□□□ -2.1
HFI1Q12060 IRC20YLR247C 4671 nt1.93□□□□□ -2.1
HFI1Q12060 YIR044CYIR044C 186 nt1.93□□□□□ -2.1
HFI1Q12060 YMR172C-AYMR172C-A 384 nt1.93□□□□□ -2.1
HFI1Q12060 VPS54YDR027C 2670 nt1.93□□□□□ -2.1
HFI1Q12060 RPS27BYHR021C 249 nt1.92□□□□□ -2.1
HFI1Q12060 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt1.92□□□□□ -2.1
HFI1Q12060 YMR321CYMR321C 318 nt1.92□□□□□ -2.1
HFI1Q12060 YOR015WYOR015W 360 nt1.92□□□□□ -2.1
HFI1Q12060 LHS1YKL073W 2646 nt1.92□□□□□ -2.1
HFI1Q12060 TDA9YML081W 3756 nt1.92□□□□□ -2.1
HFI1Q12060 tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 76 nt1.91□□□□□ -2.1
HFI1Q12060 JLP2YMR132C 627 nt1.91□□□□□ -2.1
HFI1Q12060 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt1.91□□□□□ -2.1
HFI1Q12060 IES4YOR189W 351 nt1.91□□□□□ -2.1
HFI1Q12060 CUL3YGR003W 2235 nt1.91□□□□□ -2.1
HFI1Q12060 HSL1YKL101W 4557 nt1.91□□□□□ -2.1
HFI1Q12060 NOC3YLR002C 1992 nt1.9□□□□□ -2.1
HFI1Q12060 TMA7YLR262C-A 195 nt1.9□□□□□ -2.11
HFI1Q12060 CFT1YDR301W 4074 nt1.9□□□□□ -2.11
HFI1Q12060 FIG2YCR089W 4830 nt1.9□□□□□ -2.11
HFI1Q12060 BLI1YKL061W 342 nt1.88□□□□□ -2.11
HFI1Q12060 PTP2YOR208W 2253 nt1.87□□□□□ -2.11
HFI1Q12060 SEC5YDR166C 2916 nt1.87□□□□□ -2.11
HFI1Q12060 SPO75YLL005C 2607 nt1.87□□□□□ -2.11
HFI1Q12060 RPS25BYLR333C 327 nt1.87□□□□□ -2.11
HFI1Q12060 SLI15YBR156C 2097 nt1.87□□□□□ -2.11
HFI1Q12060 RPL31AYDL075W 342 nt1.86□□□□□ -2.11
HFI1Q12060 GPG1YGL121C 381 nt1.86□□□□□ -2.11
HFI1Q12060 SPO24YPR036W-A 204 nt1.86□□□□□ -2.11
HFI1Q12060 YPR092WYPR092W 306 nt1.86□□□□□ -2.11
HFI1Q12060 YLL007CYLL007C 1998 nt1.86□□□□□ -2.11
HFI1Q12060 MEC1YBR136W 7107 nt1.86□□□□□ -2.11
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