Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNA1Q09470 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNA1Q09470 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNA1Q09470 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNA1Q09470 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNA1Q09470 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNA1Q09470 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNA1Q09470 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNA1Q09470 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNA1Q09470 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNA1Q09470 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNA1Q09470 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNA1Q09470 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNA1Q09470 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNA1Q09470 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNA1Q09470 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNA1Q09470 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNA1Q09470 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNA1Q09470 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNA1Q09470 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNA1Q09470 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNA1Q09470 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNA1Q09470 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNA1Q09470 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNA1Q09470 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNA1Q09470 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNA1Q09470 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNA1Q09470 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNA1Q09470 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNA1Q09470 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNA1Q09470 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNA1Q09470 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNA1Q09470 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNA1Q09470 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNA1Q09470 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNA1Q09470 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNA1Q09470 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNA1Q09470 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNA1Q09470 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNA1Q09470 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNA1Q09470 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNA1Q09470 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNA1Q09470 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNA1Q09470 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNA1Q09470 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNA1Q09470 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNA1Q09470 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNA1Q09470 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNA1Q09470 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNA1Q09470 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNA1Q09470 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNA1Q09470 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNA1Q09470 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNA1Q09470 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNA1Q09470 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNA1Q09470 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNA1Q09470 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNA1Q09470 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNA1Q09470 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNA1Q09470 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNA1Q09470 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNA1Q09470 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNA1Q09470 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNA1Q09470 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNA1Q09470 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNA1Q09470 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNA1Q09470 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNA1Q09470 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNA1Q09470 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNA1Q09470 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNA1Q09470 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNA1Q09470 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNA1Q09470 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNA1Q09470 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNA1Q09470 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNA1Q09470 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNA1Q09470 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNA1Q09470 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNA1Q09470 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNA1Q09470 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNA1Q09470 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNA1Q09470 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNA1Q09470 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNA1Q09470 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNA1Q09470 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNA1Q09470 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNA1Q09470 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNA1Q09470 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNA1Q09470 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNA1Q09470 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNA1Q09470 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNA1Q09470 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNA1Q09470 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNA1Q09470 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNA1Q09470 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNA1Q09470 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNA1Q09470 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNA1Q09470 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNA1Q09470 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNA1Q09470 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms