Protein–RNA interactions for Protein: Q08972

NEW1, [NU+] prion formation protein 1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 1,196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NEW1Q08972 SEF1YBL066C 3447 nt2.17□□□□□ -2.06
NEW1Q08972 KOG1YHR186C 4674 nt2.16□□□□□ -2.06
NEW1Q08972 YGR164WYGR164W 336 nt2.16□□□□□ -2.06
NEW1Q08972 INA22YIR024C 651 nt2.16□□□□□ -2.06
NEW1Q08972 ATP7YKL016C 525 nt2.16□□□□□ -2.06
NEW1Q08972 YNL097C-BYNL097C-B 123 nt2.16□□□□□ -2.06
NEW1Q08972 TDA9YML081W 3756 nt2.16□□□□□ -2.06
NEW1Q08972 DIS3YOL021C 3006 nt2.16□□□□□ -2.06
NEW1Q08972 SSQ1YLR369W 1974 nt2.16□□□□□ -2.06
NEW1Q08972 CFT2YLR115W 2580 nt2.15□□□□□ -2.06
NEW1Q08972 YOR343W-BYOR343W-B 5313 nt2.15□□□□□ -2.06
NEW1Q08972 NPC2YDL046W 522 nt2.15□□□□□ -2.07
NEW1Q08972 YEL014CYEL014C 306 nt2.15□□□□□ -2.07
NEW1Q08972 PCC1YKR095W-A 267 nt2.15□□□□□ -2.07
NEW1Q08972 COF1YLL050C 432 nt2.15□□□□□ -2.07
NEW1Q08972 ELG1YOR144C 2376 nt2.15□□□□□ -2.07
NEW1Q08972 IRR1YIL026C 3453 nt2.15□□□□□ -2.07
NEW1Q08972 PAN3YKL025C 2040 nt2.14□□□□□ -2.07
NEW1Q08972 YGL217CYGL217C 342 nt2.14□□□□□ -2.07
NEW1Q08972 YBL012CYBL012C 402 nt2.14□□□□□ -2.07
NEW1Q08972 MGA2YIR033W 3342 nt2.14□□□□□ -2.07
NEW1Q08972 YGR250CYGR250C 2346 nt2.14□□□□□ -2.07
NEW1Q08972 SSS1YDR086C 243 nt2.13□□□□□ -2.07
NEW1Q08972 OLI1Q0130 231 nt2.13□□□□□ -2.07
NEW1Q08972 CSE2YNR010W 450 nt2.13□□□□□ -2.07
NEW1Q08972 TOF2YKR010C 2316 nt2.13□□□□□ -2.07
NEW1Q08972 ATG11YPR049C 3537 nt2.13□□□□□ -2.07
NEW1Q08972 GYP5YPL249C 2685 nt2.13□□□□□ -2.07
NEW1Q08972 FAB1YFR019W 6837 nt2.12□□□□□ -2.07
NEW1Q08972 snR74snR74 88 nt2.12□□□□□ -2.07
NEW1Q08972 VPS55YJR044C 423 nt2.12□□□□□ -2.07
NEW1Q08972 RPS27AYKL156W 249 nt2.12□□□□□ -2.07
NEW1Q08972 TFC8YPL007C 1767 nt2.12□□□□□ -2.07
NEW1Q08972 PUT3YKL015W 2940 nt2.12□□□□□ -2.07
NEW1Q08972 REV3YPL167C 4515 nt2.11□□□□□ -2.07
NEW1Q08972 YBL053WYBL053W 375 nt2.11□□□□□ -2.07
NEW1Q08972 YNL028WYNL028W 318 nt2.11□□□□□ -2.07
NEW1Q08972 YBR131C-AYBR131C-A 90 nt2.11□□□□□ -2.07
NEW1Q08972 YBR178WYBR178W 375 nt2.11□□□□□ -2.07
NEW1Q08972 YDR426CYDR426C 378 nt2.1□□□□□ -2.07
NEW1Q08972 YHR073W-AYHR073W-A 177 nt2.1□□□□□ -2.07
NEW1Q08972 YLR255CYLR255C 354 nt2.1□□□□□ -2.07
NEW1Q08972 RPL38YLR325C 237 nt2.1□□□□□ -2.07
NEW1Q08972 YMR045CYMR045C 5268 nt2.1□□□□□ -2.07
NEW1Q08972 TOR2YKL203C 7425 nt2.09□□□□□ -2.07
NEW1Q08972 RPL42BYHR141C 321 nt2.09□□□□□ -2.07
NEW1Q08972 RPL42AYNL162W 321 nt2.09□□□□□ -2.07
NEW1Q08972 EMP24YGL200C 612 nt2.08□□□□□ -2.08
NEW1Q08972 TMA7YLR262C-A 195 nt2.08□□□□□ -2.08
NEW1Q08972 PDE2YOR360C 1581 nt2.07□□□□□ -2.08
NEW1Q08972 SEC63YOR254C 1992 nt2.07□□□□□ -2.08
NEW1Q08972 NUT2YPR168W 474 nt2.07□□□□□ -2.08
NEW1Q08972 snR46snR46 197 nt2.07□□□□□ -2.08
NEW1Q08972 PEP1YBL017C 4740 nt2.07□□□□□ -2.08
NEW1Q08972 UBR2YLR024C 5619 nt2.06□□□□□ -2.08
NEW1Q08972 RRT15YLR162W-A 189 nt2.06□□□□□ -2.08
NEW1Q08972 YML007C-AYML007C-A 111 nt2.06□□□□□ -2.08
NEW1Q08972 YNL114CYNL114C 372 nt2.06□□□□□ -2.08
NEW1Q08972 LCD1YDR499W 2244 nt2.06□□□□□ -2.08
NEW1Q08972 SEY1YOR165W 2331 nt2.06□□□□□ -2.08
NEW1Q08972 LRE1YCL051W 1752 nt2.05□□□□□ -2.08
NEW1Q08972 CUL3YGR003W 2235 nt2.05□□□□□ -2.08
NEW1Q08972 YBL109WYBL109W 336 nt2.05□□□□□ -2.08
NEW1Q08972 YOR376WYOR376W 369 nt2.05□□□□□ -2.08
NEW1Q08972 YPR092WYPR092W 306 nt2.05□□□□□ -2.08
NEW1Q08972 NOP53YPL146C 1368 nt2.05□□□□□ -2.08
NEW1Q08972 IRE1YHR079C 3348 nt2.04□□□□□ -2.08
NEW1Q08972 MYO4YAL029C 4416 nt2.04□□□□□ -2.08
NEW1Q08972 VPS54YDR027C 2670 nt2.04□□□□□ -2.08
NEW1Q08972 snR52snR52 92 nt2.04□□□□□ -2.08
NEW1Q08972 SAC3YDR159W 3906 nt2.04□□□□□ -2.08
NEW1Q08972 MPT5YGL178W 2580 nt2.04□□□□□ -2.08
NEW1Q08972 MUK1YPL070W 1839 nt2.03□□□□□ -2.08
NEW1Q08972 PEX8YGR077C 1770 nt2.03□□□□□ -2.08
NEW1Q08972 YJR039WYJR039W 3366 nt2.03□□□□□ -2.08
NEW1Q08972 CTR9YOL145C 3234 nt2.03□□□□□ -2.08
NEW1Q08972 YDR524C-AYDR524C-A 120 nt2.03□□□□□ -2.08
NEW1Q08972 RPL34BYIL052C 366 nt2.03□□□□□ -2.08
NEW1Q08972 YBR182C-AYBR182C-A 195 nt2.03□□□□□ -2.08
NEW1Q08972 YIR030W-AYIR030W-A 384 nt2.02□□□□□ -2.09
NEW1Q08972 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt2.02□□□□□ -2.09
NEW1Q08972 DFG16YOR030W 1860 nt2.02□□□□□ -2.09
NEW1Q08972 MSH6YDR097C 3729 nt2.02□□□□□ -2.09
NEW1Q08972 SEC5YDR166C 2916 nt2.02□□□□□ -2.09
NEW1Q08972 MSC6YOR354C 2079 nt2.02□□□□□ -2.09
NEW1Q08972 RPS27BYHR021C 249 nt2.01□□□□□ -2.09
NEW1Q08972 TRX1YLR043C 312 nt2.01□□□□□ -2.09
NEW1Q08972 RTP1YMR185W 2946 nt2.01□□□□□ -2.09
NEW1Q08972 VPS34YLR240W 2628 nt2.01□□□□□ -2.09
NEW1Q08972 HIR3YJR140C 4947 nt2□□□□□ -2.09
NEW1Q08972 HSH155YMR288W 2916 nt2□□□□□ -2.09
NEW1Q08972 YHR071C-AYHR071C-A 321 nt2□□□□□ -2.09
NEW1Q08972 PAU18YLL064C 363 nt2□□□□□ -2.09
NEW1Q08972 PAU6YNR076W 363 nt2□□□□□ -2.09
NEW1Q08972 SGF11YPL047W 300 nt2□□□□□ -2.09
NEW1Q08972 TBS1YBR150C 3285 nt2□□□□□ -2.09
NEW1Q08972 YOR329W-AYOR329W-A 210 nt1.99□□□□□ -2.09
NEW1Q08972 YOR381W-AYOR381W-A 168 nt1.99□□□□□ -2.09
NEW1Q08972 YCL046WYCL046W 324 nt1.99□□□□□ -2.09
NEW1Q08972 SPT21YMR179W 2277 nt1.99□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 30.3 ms