Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms